AWSで環境変数を設定する方法について

前提・実現したいこと

AWSで./bash_profile以外で環境変数を設定する方法が知りたいです。
./bash_profileでライブラリのインストール先を環境変数に設定したところ、それまで使えていたコマンドが使用できなくなりました。

発生している問題・エラーメッセージ

AWSのDeep Learning AMI (Ubuntu 18.04) Version 35.0を使用しています。
形態素解析を行おうと思い、janome, MeCab, NEologdをインストールしました。
しかし、MeCabを使うときに以下のエラーが出てしまいます。

エラーメッセージで検索したところ、MeCabのインストール先を環境変数に設定すれば良いとのことだったので ~~/.bash_profile を作成して環境変数を設定しました。(~~/.bash_profileはもともとは存在していませんでした。)

export MECABRC='/etc/mecabrc'

以下のサイトを参考にしました。
https://bokunoitnisshi.hatenablog.com/entry/2020/08/01/165215

ログアウトして再度ログインしたところ、condaやsource activate等のコマンドが使えなくなってしまいました。
もともとなかった.bash_profileを作成したために環境変数を汚染してしまったと考えているのですが、bash_profile以外のどこで環境変数を設定すればいいかがわかりません。