python3.13の仮想環境でRun-time dependency scipy-openblas found:NO (tried pkgconfig)が解決しないです。

Question

実現したいこと

仮想環境でエラーなくpip install~ をできるようにしたい。

発生している問題・分からないこと

仮想環境でpip install (numpy,pandas,seaborn...)をすると必ずRun-time dependency scipy-openblas found:NO (tried pkgconfig)のエラーが出ます。
sudo apt install openblasは最新バージョンです。
pipもupgradeしています。

エラーメッセージ

Collecting numpy
  Using cached numpy-2.2.1.tar.gz (20.2 MB)
  Installing build dependencies ... done
  Getting requirements to build wheel ... done
  Installing backend dependencies ... done
  Preparing metadata (pyproject.toml) ... error
  error: subprocess-exited-with-error
  
  × Preparing metadata (pyproject.toml) did not run successfully.
  │ exit code: 1
  ╰─> [52 lines of output]

Library m found: YES
Run-time dependency scipy-openblas found: NO (tried pkgconfig)
Run-time dependency openblas found: YES 0.3.13
Message: BLAS symbol suffix:
Run-time dependency openblas found: YES 0.3.13
Checking if "Check atomic builtins without -latomic" : links: YES

Configuring __config__.py using configuration
      
      ../numpy/_core/meson.build:145:31: ERROR: Can not run test applications in this cross environment.
      
      A full log can be found at /tmp/pip-install-gweefajk/numpy_731b1bcc2fc645c7b3702ffbeea1d11b/.mesonpy-ktpzzj_r/meson-logs/meson-log.txt
      [end of output]
  
  note: This error originates from a subprocess, and is likely not a problem with pip.
error: metadata-generation-failed

× Encountered error while generating package metadata.
╰─> See above for output.

note: This is an issue with the package mentioned above, not pip.
hint: See above for details.

該当のソースコード

有効中の仮想環境 : pip install numpy

試したこと・調べたこと

• teratailやGoogle等で検索した
• ソースコードを自分なりに変更した
• 知人に聞いた
• その他

上記の詳細・結果

sudo apt install openblasもやったがなにもならずです。

補足

python3.13.1を公式からダウンロードし、解凍、altinstallをしたうえでpython3.13の仮想環境をさくせいしています。

Comments

[quickquip]

OS(ディストリビューション)とCPUアーキテクチャの情報を質問に載せた方がよいと思います（質問を編集しましょう）

[quickquip]

あとメッセージに書いてあるとおり、ログを読みましょう/載せましょう

[meg_]

> python3.13の仮想環境で
仮想環境はどの方法で作成されましたか？

[baikin]

cdで移動して
python3.13 -m venv {フォルダ名}
で作成しました。

[meg_]

> A full log can be found at /tmp/pip-install-gweefajk/numpy_731b1bcc2fc645c7b3702ffbeea1d11b/.mesonpy-ktpzzj_r/meson-logs/meson-log.txt
上記ログファイルには何か他に書かれていませんでしたか？

[baikin]

上記ログファイルをテキストエディタで開いたら、まっさらで何も書かれていませんでした。

[quickquip]

OS は Raspbian 32bit ……?

[syoshinsya-]

scipy-openblasがNOになっているのなら、これをインストールすればいいのかなと…単純に思ったんですが既に試されてぃすかね?

[melian]

> ../numpy/_core/meson.build:145:31: ERROR: Can not run test applications in this cross environment.

同様のエラーが Meson の GitHub リポジトリで報告されています。

"Can not run test applications in this cross environment" not consistent with meson.can_run_host_binaries() · Issue #13841 · mesonbuild/meson
https://github.com/mesonbuild/meson/issues/13841

問題は解決済みで、master branch にマージされています。(2024/11/29時点)

environment: Never require an exe_wrapper for native builds by smcv · Pull Request #13930 · mesonbuild/meson
https://github.com/mesonbuild/meson/pull/13930/commits/057aad14ce153b9b71c5812e41b6306bc76361f9

[baikin]

解決しました。
結論は、ラズパイのOSが32bitだったのが問題だったようです。
最近Pythonに触れ始めたので32bitに対応していないこと自体を知りませんでした。
質問してくださった皆さん、ありがとうございました。

[quickquip]

最初から書いてあれば秒で解決したでしょうに……

Answer 1

状況がよく分かりませんが上記のメッセージはビルド済みのパッケージをインストールしている訳ではなく
ソースからビルドしている感じなので，必要なパッケージはopenblasではなくlibopenblas-devではないでしょうか？

それはさておき，aptで「src package」を取得している設定になっているなら

sudo apt build-dep python3-numpy

でビルドに必要なパッケージが全部入るのではないでしょうか。

上のコマンド実行時に「ソースパッケージがダウンロードできないよ」みたいなメッセージが出たら，
設定を追加してsudo apt updateする必要がありますが，
私は自分が利用している環境以外はよく分からないので
私以外の親切な回答者の方に，問い合わせてみて下さい。

その時に，linuxのディストリビューションとバージョンを伝えることをお忘れなく。
自分が使っているubuntuの24.04と22.04でも/etc/apt/以下の設定の書き方が変わっています。

Comments

[baikin]

回答ありがとうございます。
openblasのところは単純に投稿の書き間違えでした。すみません。
上記のコマンドを実行しましたがnumpyをインストールしたときに同じエラーが出ました。
システムをみたらRaspbian GNU/Linux 11 (bullseye)ということでした。
もともとインストールされていたPython3.9で仮想環境を作成した際には何も問題なくpip install numpy,pandas,,,,,,ができました。
普段はプログラムを書いているだけでシステムのことについては無知の状態でpythonのバージョンを変えると具体的にどのような変化があるのかもわからずなので、この機会に勉強したいと思います。

Answer 2

ラズパイOSを変更する。