MDS(多次元尺度構成法）について

Question

多次元尺度構成法において、距離行列に欠けがある場合どのようにすればよいのかご存じの方いらっしゃいますか？
具体的に言うと、2点間の類似度（距離）が不明の場合です。
よろしくお願いいたします。