2つのテキストファイルを読み込み・加工したい

Question

前提・実現したいこと

下記のテキストファイル群のうち，fasta.txt内の">"以降の名称(Abe, Sato, Seo)に，それに応じた順番のemboss.txt内の"Five ="の要素を付与したファイル(output.csv)を生成するようなコードを書きたいです．("理想の出力"参照)

尚，このファイルは約1000行のファイルを縮小・簡略化したものである為，行の指定含め自動化してくれるような完成形の一例を示していただけますと幸いです．宜しくお願いします．

該当のソースコード

#!/usr/bin/python
# -*- coding: utf-8 -*-
input_path1 = "fasta.txt"
input_path2 = "emboss.txt"
output_path = "output.csv"

with open(input_path1) as f:
    text1 = f.read()
with open(input_path2) as g:
    text2 = g.read()

# 文字列の途中の改行を消す
text1 = re.sub(r"([a-zA-Z])\n([a-zA-Z])", r"\1\2", text1)

with open(output_path, "w") as f:
#以下不明

使用ファイル1

>Abe |
FLNALRRERV
>Sato |
FLNALRRERV
>Seo | 
YLNTLRKERV

使用ファイル2

One = 11136.42  		Two = 105 \
Three  = 110.484 	Four   = 2.6 \
Five = 7.4662 \
Six  = 4470 \
Seven = 0.400 \
Eight = 0.915 \

One = 11166.39  		Two = 102 \
Three  = 109.474 	Four   = 2.5 \
Five = 7.4671 \
Six  = 4470 \
Seven = 0.400 \
Eight = 0.915 \

One = 11166.54  		Two = 110 \
Three  = 108.486 	Four   = 2.4 \
Five = 7.4674 \
Six  = 4470 \
Seven = 0.400 \
Eight = 0.915 \

理想の出力

Abe, 7.4662
Sato, 7.4671
Seo, 7.4674

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

macOS10.15.4 Python3.7.3 Atom

Answer 1

こんな感じです。
名前部分やFive部分を抽出する正規表現は細かい仕様がわからないので割とざっくりです。

import re

input_path1 = "fasta.txt"
input_path2 = "emboss.txt"
output_path = "output.csv"

# fasta.txtから>から始まる名前の抽出
text_list1 = []
with open(input_path1) as f:
    text_list1 = [re.sub(r">([a-zA-Z]+)\s+\|\s*", r"\1", s) for s in f.read().splitlines() if re.match('>', s)]

# emboss.txtからFiveから始まる数値の抽出
text_list2 = []
with open(input_path2) as f:
    text_list2 = [re.sub(r"Five = ([0-9.]+)\s+\", r"\1", s) for s in f.read().splitlines() if re.match('Five', s)]

# 二つの配列を結合してcsv形式にする
result_list = [f'{text1}, {text2}' for text1, text2 in zip(text_list1, text_list2)]

# ファイル書き出し
with open(output_path, mode='w') as f:
    f.write('\n'.join(result_list))

Comments

[Male_soprano]

返信遅くなり大変失礼致しました！有難うございます．