質問をすることでしか得られない、回答やアドバイスがある。

15分調べてもわからないことは、質問しよう!

新規登録して質問してみよう
ただいま回答率
85.48%
Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

Q&A

解決済

2回答

3965閲覧

pythonで16bitのtiff画像を読み込みたい

bas

総合スコア9

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

0グッド

0クリップ

投稿2020/07/06 05:46

pythonで16bitのtiff画像を読み込みたいです。そこで,tifffileパッケージを用いて以下のコードで画像の読み込みを行いました。

import tifffile PATH = "/mnt/dataDrive/image/3/2020_1_10/2_32_39_depthfield.tiff" img = tifffile.imread(PATH)

pythonのバージョンは3.6.8でcentos7を使っています。
しかし,以下のようなエラーが出てきました。

--------------------------------------------------------------------------- ValueError Traceback (most recent call last) <ipython-input-2-56c32408d22b> in <module> 1 import tifffile 2 PATH = "/mnt/dataDrive/image/3/2020_1_10/2_32_39_depthfield.tiff" ----> 3 img = tifffile.imread(PATH) /usr/lib/python3.6/site-packages/tifffile/tifffile.py in imread(files, **kwargs) 714 if isinstance(files, basestring) or hasattr(files, 'seek'): 715 with TiffFile(files, **kwargs_file) as tif: --> 716 return tif.asarray(**kwargs) 717 else: 718 with TiffSequence(files, **kwargs_seq) as imseq: /usr/lib/python3.6/site-packages/tifffile/tifffile.py in asarray(self, key, series, out, validate, maxworkers) 2411 elif len(pages) == 1: 2412 result = pages[0].asarray(out=out, validate=validate, -> 2413 maxworkers=maxworkers) 2414 else: 2415 result = stack_pages(pages, out=out, maxworkers=maxworkers) /usr/lib/python3.6/site-packages/tifffile/tifffile.py in asarray(self, out, squeeze, lock, reopen, maxsize, maxworkers, validate) 4355 if self.compression not in TIFF.DECOMPESSORS: 4356 raise ValueError('TiffPage %i: cannot decompress %s' -> 4357 % (self.index, self.compression.name)) 4358 if 'SampleFormat' in tags: 4359 tag = tags['SampleFormat'] ValueError: TiffPage 0: cannot decompress PACKBITS

どのように解決すればよいのか教えて頂きたいです。
また,別の手法がありましたらそちらを教えて頂きたいです。
ただ,読み込んだ際に8bit画像になってしまうようなものは避けたいです。
よろしくお願いします。

気になる質問をクリップする

クリップした質問は、後からいつでもMYページで確認できます。

またクリップした質問に回答があった際、通知やメールを受け取ることができます。

バッドをするには、ログインかつ

こちらの条件を満たす必要があります。

guest

回答2

0

自己解決

パッケージの互換性の問題でした。
お騒がせしました。

投稿2020/08/28 05:57

bas

総合スコア9

バッドをするには、ログインかつ

こちらの条件を満たす必要があります。

0

仔細は不明ですが、最近PackBitsに関するアップデートがあります。

2020.5.30

Re-add pure Python PackBits decoder.

以前のバージョンではPackBitsに対応していないかった可能性があります。

tifffileモジュールを最新版に更新して実行してみてください。

投稿2020/07/06 11:09

hope_mucci

総合スコア4447

バッドをするには、ログインかつ

こちらの条件を満たす必要があります。

bas

2020/07/09 05:00

回答ありがとうございます。 tifffileモジュールを最新版にしましたが,改善されませんでした...
hope_mucci

2020/07/09 05:29

最新版にしたのであれば同じエラーは発生しないはずです。(そもそもソースに当該エラーを出力する箇所がない) もう一度確認してみてください。またアップデートした最新版のバージョンも確認してみてください。
guest

あなたの回答

tips

太字

斜体

打ち消し線

見出し

引用テキストの挿入

コードの挿入

リンクの挿入

リストの挿入

番号リストの挿入

表の挿入

水平線の挿入

プレビュー

15分調べてもわからないことは
teratailで質問しよう!

ただいまの回答率
85.48%

質問をまとめることで
思考を整理して素早く解決

テンプレート機能で
簡単に質問をまとめる

質問する

関連した質問