eclipseでgradleマルチプロジェクト構成にしたとき、ルートプロジェクトとサブプロジェクトのリソースが重複する

Question

前提・実現したいこと

eclipseでgradleを使用し、以下のようなマルチプロジェクト構成のビルドを行おうとしています。

- projectRoot
  - subproject1
    - src
      - main
        - java
          - example
            - Example.java
  - subproject2
    - src
         ・・・
  build.gradle
  setting.gradle

ビルド自体は成功し、アプリケーションも問題なく動くのですが、Ctrl+Shift+Rでリソース検索する際に同じソースが複数表示されます。
具体的には以下のように表示されます。
projectRoot/subproject1/src/main/java/example/Example.java
subproject1/src/main/java/example/Example.java
※実態は同じファイル

ルートプロジェクト側のソースをリソースとして認識させないようにする方法があればご教示いただきたいです。
（↓だけ表示されるようにしたい）
subproject1/src/main/java/example/Example.java

該当のソースコード

build.gradle

plugins {
   id 'org.springframework.boot' version "2.2.6.RELEASE"
   id 'io.spring.dependency-management' version '1.0.9.RELEASE'
}

subprojects {
    apply plugin: 'eclipse'
    apply plugin: 'org.springframework.boot'
    apply plugin: 'io.spring.dependency-management'
    apply plugin: 'java'

    group = 'com.example'
    version = "1.0.0"
    sourceCompatibility = '11'

    [compileJava, compileTestJava, javadoc].each { it.options.encoding = "UTF-8" }

    configurations {
        developmentOnly
        runtimeClasspath {
            extendsFrom developmentOnly
        }
        compileOnly {
            extendsFrom annotationProcessor
        }
    }

    repositories {
        mavenCentral()
    }

    dependencies {
        // 省略
    }

    test.enabled = false

}

project(':subproject1') {

    dependencies {
       // 省略
    }

    jar.enabled = true
    bootJar.enabled = false

}

project(':subproject2') {

    apply plugin: 'war'

    dependencies {
        implementation project(':subproject1')
        // 省略
    }
}

setting.gradle

rootProject.name = 'rootProject'
include ':subproject1', ':subproject2'

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

eclipse: 2020-03
gradle: 7.0

Answer 1

@SpringBootApplication(nameGenerator =  **** )

の設定で別名にしましょう

Comments

[hokeke]

ご回答いただきありがとうございます。
Bean名が重複しているわけではないのです。
（アプリケーションは問題なく動作しています）
質問内容が分かりにくかったかもしれません。少し修正しました。