opencvのimportでのエラーを解決したい

Question

前提・実現したいこと

プログラム初心者です。

ラズベリーパイで、カメラから画像を取り込み、画像処理するため、opencvをインストールしました。
その後、確認プログラムを作成したところ、以下の様な「importerorr」が発生しました。

エラーメッセージ

%Run test.py

Traceback (most recent call last):
File "/home/pi/test.py", line 1, in <module>
import cv2
File "/usr/local/lib/python3.7/dist-packages/cv2/init.py", line 3, in <module>
from .cv2 import *
ImportError: /usr/local/lib/python3.7/dist-packages/cv2/cv2.cpython-37m-arm-linux-gnueabihf.so: undefined symbol: __atomic_fetch_add_8

該当のソースコード

import cv2
print(cv2.version)

試したこと

どうようのエラーの対処方法をみつけたので、以下の操作を行いました。

LD_PRELOAD=/usr/lib/arm-linux-gnueabihf/libatomic.so.1

以下、vimの編集など、良くわからず、実施出来ませんでした。

vim.tiny .bashrc
export LD_PRELOAD=/usr/lib/arm-linux-gnueabihf/libatomic.so.1 #この一文を追加

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

raspberrypi3b
python3.7.3

Answer 1

Vimを使わずに、他のテキストエディタを使えばいいのでは？
CLIでなければいけないのならば、nanoがおすすめですよ。
（nano [ファイル名]で編集できます）

Comments

[nao99]

ご回答有難うございます。
初心者でして、vimで何をしようとしてるのかも分からず、CLIでなけらばいけないのかも分からない状況です。importerrorの対策として、他の処置方法は無いのでしょうか。

[Hiro527]

恐らく、ホームディレクトリにある.bashrcというファイルに
export LD_PRELOAD=/usr/lib/arm-linux-gnueabihf/libatomic.so.1
という一文を追記すれば良いのだと思います。
ご存知かと思いますが、vimやnanoはコマンドプロンプト上で使えるテキストエディタです。Raspbianを使っているのであれば、他のテキストエディタを使っても平気だと思います。
とりあえず↑のことをやってみて、無理でしたらもう一度教えて下さい。

[nao99]

.bashrcのファイルが非表示でしたが、ホームディレクトリで見つかり変更修正出来ました。
端末ターミナルでは、opencv をバージョン表示出来て、認識しました。

しかし、そもそもの”importerror”の発生は、Pythonの開発環境「Thonny」で発生しており、こちらのエラーは変化はありませんでした。

確認のため、.bashrcの一文追加を削除してみましたが、端末ターミナルではエラーは発生しませんでした。

[Hiro527]

端末上で
$ python test.py
を実行すればエラーは出ないんですね？
では、Thonnyと実行環境の連携がうまく行っていない可能性があります。
Thonnyの方で「Tools」→「Open System Shell...」で端末を開いて、
pip list
を実行してください。その中にopencv-pythonが無ければ、
pip install opencv-python
でインストール直してください。それで解決されるはずです。
それでもだめなら、考え直しましょう。

[nao99]

はい。その通りです。
上記の通り、pip list を実行した結果、opencv-python 4.1.1.26が存在します。
パスが通っていない？とかはあるのでしょうか。

[Hiro527]

pip listは【Thonnyから起動した】端末で確認したのでしょうか？インストールができていればインポートはできると思うのですが。

[nao99]

Thonnyから起動した端末で確認しました。再度、Thonnyで　test.pyを実行すると、やはり同様のエラーが発生します。

[Hiro527]

恐らくこの記事（https://qiita.com/XM03/items/48463fd910470b226f22）を読まれたの思うのですが、上の方にあるライブラリのインストールはやりましたか？恐らくそのせいかと。

上にあるエラーはライブラリの依存関係が解決されていないから（ライブラリ不足）発生しているものです。ライブラリをインストールできれば解決するはずです。

[nao99]

はい。
このページを読みました。ライブラリのインストールは、実施したか曖昧だったので、再度実行しましたが、既に実行済みでした。
結果、再度、Thonnyで、test.pyを実行しましたが、結果は変わらずです。

[Hiro527]

ダメ押し感半端ないですが、Thonnyをrootユーザーとして起動してみてはどうでしょう？
$ sudo thonny

[nao99]

やはり、駄目ですね(>_<)

[Hiro527]

ライブラリをインストールしたPythonのバージョンは、どうでしょうか…？
pip3でないと2.7.xの環境に入れられてしまいます
Raspbianは標準ではPython2.7.xのはずなので…。
Thonnyで実行する際は恐らく自動的にPython 3.x.xを使ってると思うのですが

[Hiro527]

参考までに
$ sudo apt install python3 python3-pip

[nao99]

Python3.7.3です。
アップグレードしたタイミングが、分かりませんが。

[Hiro527]

ですよね…。
一応GitHubでこの方法を見つけたので試してみては？
$ LD_PRELOAD=/usr/lib/arm-linux-gnueabihf/libatomic.so.1 thonny &

[Hiro527]

http://www.yoyojacky.com/?p=559
中国語ですが、参考になるかと。

[nao99]

$ LD_PRELOAD=/usr/lib/arm-linux-gnueabihf/libatomic.so.1 thonny &

で立ち上がったThonnyで、test.pyを実行したら、4.1.1と表示されました。

一度、Thonnyを閉じて、直接Thonnyを、立ち上げてだと、エラーとなります。

毎回、端末からThonnyを立ち上げるのを避けるための対策は、どうしたら良いのでしょうか。

[Hiro527]

ホームディレクトリにある".bashrc"をテキストエディタで開き、
export LD_PRELOAD=/usr/lib/arm-linux-gnueabihf/libatomic.so.1
を追記します。
そして、端末を開き、
$ source .bashrc
を実行してください。これで解決されるはずです。
ですが、少しだけデメリットがあります。GitHubのフォーラムによると、この方法を行うとどんな実行ファイルでも実行時にlibatomic.so.1が読み込まれてしまうそうです。どんな副作用が出るかわかりませんが、一応伝えておきます。
一応、参考にしたページです→https://github.com/piwheels/packages/issues/59

[nao99]

ご丁寧に有り難うございます。

ですが、

export LD_PRELOAD=/usr/lib/arm-linux-gnueabihf/libatomic.so.1
を追記、

$ source .bashrcを実行済みです(>_<)

[Hiro527]

どうやら、【再起動をするとそのたびにもう一回】
$ source .bashrc
を行わないといけないらしいので、.bashrcに
source .bashrc
を追加したほうが良いみたいです。

[nao99]

今朝から、端末ターミナル（LXTerminal）で、pi@raspberrypi の表示が出なくなりました。

Thonnyから端末を立ち上げると、pi@raspberrypi　が表示されます。

何回か、Rebootしましたが、状況は変わりません。

[nao99]

ツールバーに、「ファイル」「編集」「ヘルプ」と表示されて、テキストファイルになっているようです。

[nao99]

.bashrcに
source .bashrの追加を削除(元に戻す)と、復帰しました。

[nao99]

他のプログラムも、問題なく、端末、Thonnyから、正常に動作するようになりました。

長時間、有り難うございました。

[Hiro527]

いえ、こちらこそありがとうございます。
あまり力になれなかったと思いますが、解決できたのであればこちらも嬉しいです:)

これからもよろしくお願いします

[Hiro527]

一つおまけ情報ですが、Raspbianのデスクトップのショートカットは編集できるので、コマンドのところを
LD_PRELOAD=/usr/lib/arm-linux-gnueabihf/libatomic.so.1 thonny &
にすると使うのが楽かと。あと、エイリアスも便利かもしれないです

Answer 2

OpenCVのバージョンを4.1.1.26から4.1.0.25へ変更することでも
解決することができました。

ラズパイのターミナルで下記コマンドを実行

sudo pip3 install opencv-python==4.1.0.25

状況によっては下記も必要です。

sudo pip3 install opencv-contrib-python==4.1.0.25

参考サイト
https://qiita.com/kakimochi/items/2ff45534f32270094e9b

Comments

[nao99]

ご回答有難うございます。

sudo pip3 install opencv-python==4.1.0.25

で、すんなり解決しました。