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同フォルダ内の複数のcsvファイルのグラフ化を一括させたいです

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toikouya

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前提・実現したいこと- リスト

csvファイルのデータ(複数)を一括グラフ化、保存
ひとつひとつファイル名を書き換えてやるのは非効率的だと思うので、
よりよい方法を試したいです。

現在pythonを使っています。

発生している問題・エラーメッセージ

ファイル名を共通させたい
複数のファイルにこのプログラムを適用させたい
なるべく少量のコードで済ませたい

該当のソースコード

import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.ticker as ticker
from pandas.plotting import scatter_matrix
import io

data = pd.read_csv("logtest 11 20191216.csv",encoding="shift-jis")   
df_tmp_humid = data.iloc[:, [5]]
df_tmp_humid.plot()
plt.xlim(0, 1440) # (3)x軸の表示範囲
plt.ylim(0, 1023) # (4)y軸の表示範囲
plt.title("logtest 11  20191216 soilmoisture")
plt.xlabel("time",fontsize=20) # (6)x軸ラベル
plt.ylabel("soilmoisture",fontsize=20)# (7)y軸ラベル
plt.show()
plt.savefig("logtest 11 20191216 soilmoisture")
plt.close()

data = pd.read_csv("logtest 11 20191216.csv",encoding="shift-jis")
df_tmp_humid = data.iloc[:, [2]]
df_tmp_humid.plot()
plt.xlim(0, 1440) # (3)x軸の表示範囲
plt.ylim(0, 50000) # (4)y軸の表示範囲
plt.title("logtest 11 20191216 light")
plt.xlabel("time",fontsize=20) # (6)x軸ラベル
plt.ylabel("light",fontsize=20)# (7)y軸ラベル

plt.savefig("logtest 11 20191216 light")
plt.show()
plt.close()

data = pd.read_csv("logtest 11 20191216.csv",encoding="shift-jis")
data.describe()
df = data.iloc[:, [3]]
plt.scatter(data['time'], data['temperature'], s=5, c="b",alpha=0.9)
plt.xlim(0, 1440) # (3)x軸の表示範囲
plt.ylim(0, 40) # (4)y軸の表示範囲
plt.title("logtest 11 20191216 temperature")
plt.xlabel("time",fontsize=20) # (6)x軸ラベル
plt.ylabel("temperature",fontsize=20)# (7)y軸ラベル
plt.savefig("logtest 11 20191216 temperature")
plt.show()
plt.close()

data = pd.read_csv("logtest 11 20191216.csv",encoding="shift-jis")
data.describe()
df = data.iloc[:, [4]]
plt.scatter(data['time'], data['humidity'], s=5, c="b",alpha=0.9)
plt.xlim(0, 1440) # (3)x軸の表示範囲
plt.ylim(0, 100) # (4)y軸の表示範囲
plt.title("logtest 11 20191216 humidity")
plt.xlabel("time",fontsize=20) # (6)x軸ラベル
plt.ylabel("humidity",fontsize=20)# (7)y軸ラベル
plt.savefig("logtest 11 20191216 humidity")
plt.show()
plt.close()

print('グラフ完了')

試したこと

対象のCSVファイルは
「logtest 11 日付.csv」
という基準で名付けています。
日付の部分は20191216~202019 まであります。
このプログラム「graph_all.py」と
同じフォルダに保存されています。

例:csvファイル
date,time,light,temperature,humidity,soilmoisture
2019/1/16,0:00,0,14,69,672
2019/1/16,0:01,0,14,69,669
2019/1/16,0:02,0,0,0,689

の形式です。

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

バージョン: 1.41.1 (user setup)
コミット: 26076a4de974ead31f97692a0d32f90d735645c0

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  • jeanbiego

    2020/01/15 11:41

    「ファイル名を共通させたい
    複数のファイルにこのプログラムを適用させたい
    なるべく少量のコードで済ませたい」
    これを、どこまでチャレンジして何がダメだったか具体的に書いたほうが回答が来ると思います。

    キャンセル

  • toikouya

    2020/01/15 12:04

    https://qiita.com/miler0528/items/5ce48a1ecf8a752ed5ef)を試してみましたが、うまくforループにそれぞれのグラフ化関数を組み込むことができませんでした。これのみです。

    キャンセル

  • toikouya

    2020/01/15 12:15

    File "l:/フォルダ/11/draw_graph all.py", line 15
     df = data.iloc[:, [5]]
    ^
    SyntaxError: invalid character in identifier 
     
    が主なエラーです。

    キャンセル

  • jeanbiego

    2020/01/15 13:07

    ここは「質問への追記・修正の依頼」欄ですので、質問欄へ書き込んだほうが良いです。他の方も見やすいので。
    なお、コードを書くときはコードの挿入(<code>ボタン)で書いてみて下さい。

    さしあたり、グラフ化コードの全体を関数でくくってみて、csvファイルのパスを引数にとって動かしてみてはいかかでしょう。それができたら、引用先のようにfor文で回すだけです。

    キャンセル

回答 1

checkベストアンサー

+1

まずは、上記のソースコードですがループ処理により、こんな感じで書けます。
(一部処理を省いておりますが)

import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.ticker as ticker

#date,time,light,temperature,humidity,soilmoisture
data = pd.read_csv("logtest 11 20191216.csv",
                   encoding="shift-jis",
                   parse_dates={'datetime': ['date','time']},
                   index_col='datetime')

for col, d in data.iteritems():
    if col not in ['temperature','humidity']:
        d.plot()
    else:
        d.plot(marker='o',linestyle='None', color="b",alpha=0.9)
    plt.title(f"logtest 11  20191216 {col}")
    plt.show()
    plt.savefig(f"logtest 11 20191216 {col}.png")
    plt.close()

print('グラフ完了')

あとは上記の処理をさらにファイルの数だけループ処理するだけです。
このサンプルではでは、data フォルダ内にある csv ファイルを全て読み込んで、output フォルダにグラフを出力します。(前もって output フォルダは作成しておいてください。)

import as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.ticker as ticker
import glob
import os

for file in glob.glob('data/*.csv'):
    basename = os.path.basename(file)
    name = os.path.splitext(basename)[0]

    data = pd.read_csv(file,
                       encoding="shift-jis",
                       parse_dates={'datetime': ['date','time']},
                       index_col='datetime')

    for col, d in data.iteritems():
        if col not in ['temperature','humidity']:
            d.plot()
        else:
            d.plot(marker='o',linestyle='None', color="b",alpha=0.9)
        plt.title(f"{name} {col}")
        #plt.show()
        plt.savefig(os.path.join('output', f"{name} {col}.png"))
        plt.close()

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  • 2020/01/17 15:07

    この方法でできました。
    ありがとうございます。

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