観測時間が不揃いなデータの1秒ごとの平均を求めたい

Question

前提・実現したいこと

実験で得られた動物の血圧を1秒ごとの平均として表したいです。
pandasで実験データを読み込みましたが、自分なりに色々しらべてみましたが、groupbyでは日付などが必要だったり、実験データが一定時間にサンプリングされているわけではないので、特定の行数で平均を出すことができません。
1秒ごとの平均を出したいので、移動平均は求めているものとは違うので苦心しております。
右側の2列にある、観測時間と実測値のデータを使用して一秒ごとの平均を求めたいです。

最近、pythonを利用してデータの解析を行いはじめたのですが、周りに頼れるひとがおりませんので、ここに質問させていただきました。
なにかいい方法をご教授いただけないでしょうか。
よろしくお願い申し上げます。

該当のソースコード

import pandas as pd
import numpy as np 
df=pd.read_csv("BP1.txt", delim_whitespace= True)
print(df)

           Time     1 HB     Time.1   2 Systol
0       0.17540 -0.24163    0.17540  87.512103
1       0.42893 -0.24171    0.42893  86.901093
2       0.67056 -0.23962    0.67056  87.694917
3       0.91227 -0.24001    0.91227  88.611195
4       1.15189 -0.23990    1.15189  89.142342
...         ...      ...        ...        ...
1459  322.54225  0.19422  322.54225  97.196960
1460  322.73647  0.20228  322.73647  97.830200
1461  322.93875  0.19289  322.93875  97.031825
1462  323.13164  0.19662  323.13164  96.513930
1463  323.32826  0.19185  323.32826  95.185343

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

Anaconda 3をダウンロードし、python3.7を使用してjupyternote book 6.01上で作業をしています。

Answer 1

pythonのコードは、不慣れなため書けませんが、
不揃いの観測データから、1秒,2秒・・・時点の値を求め、
観測データの代わりとして、そのデータをつかってなにがしかの集計をする
ということでよいのでしょうか。

例えば、１秒時点のデータを求めるため、
0＜＝　＜２　の観測データ数をカウントし、
それぞれのデータを使って、例えば最小２乗法などで
フィッティングを行い、１秒時点のデータを求める
とかどうでしょう。

サンプリング間隔が、推定に問題ないかどうか。
また、誤差がどれくらい許されるのかなど、確認すべきことは
多いと思いますが、参考までに。

Comments

[yoshithere]

そのような感じです。
アドバイス、ありがとうございました。
参考にさせていただきます。

Answer 2

いまいち何をしたいのか見えてませんが、
１秒毎のデータを集計して平均出すのではいけないんでしょうか。

Comments

[yoshithere]

説明がへたくそですいません。
そういうことがしたいです。
df["t1"] = pd.to_timedelta(df.t1, unit="s")
df.set_index("t1", append=True)
print(df)
print(df.HB. resample("1S").mean())
というのを試したのですが、
Only valid with DatetimeIndex, TimedeltaIndex or PeriodIndex, but got an instance of 'RangeIndex‘
というエラーが出てしまいました。
これを解決するためにはどのような方法を取ればよいでしょうか。
ご存知でしたら教えていただけると幸いです。
もし、これと別の方法で1秒毎のデータを集計する方法がありましたら、そちらでも結構です。
よろしくお願いします。

[y_waiwai]

エラーが出るとか問題がでるというならそれを質問に書きましょう。
詳細隠して質問投げてもあなたの望む回答は得られませんぜ

[yoshithere]

わかりました。
改めて質問し直したいと思います。