Cでatoiを使って,配列に代入する際のSegmentation fault: 11への対処

メモリを動的に確保した配列の存在するはずの場所にatoiを使ってintを代入しようとしたところSegmentation fault: 11が生じました。対応方法を教えていただきたいです。

途中までは普通に代入してるんですが、最後の行でエラーが出ます
##code

c
1/*
2ファイルを読み込んで行列サイズnを返す
3nから正方行列Aとベクトルxを格納する配列を確保
4確保した配列にファイルから入力
5Aとxとnから積b = Axを計算
6bを出力
7*/
8
9#include <stdio.h>
10#include <stdlib.h>
11#include <string.h>
12
13
14
15
16int main(void){
17  int **a; //読み込む行列(n,n)
18  int *x; //読み込むベクトル(n,1)
19  int *b; //答えベクトル(n,1)
20
21  int i, n; //i:ループ, n:サイズ
22  int len;
23  char (*p)[40];
24  char lin[40]; //1行の最大文字数
25  FILE *f_in;  //input用
26  FILE *f_out; //output用
27  char f_in_name[] = "input.txt";
28  char f_out_name[] = "output.txt";
29
30  f_in = fopen(f_in_name,"r");
31  f_out = fopen(f_out_name,"w");
32
33  n = 0;
34
35  //サイズ取得
36  while( fgets(lin,40,f_in) != NULL)
37  {
38    n++;
39  }
40  fclose(f_in);
41
42  n /= 2;
43  printf("サイズ n = %d\n",n);
44
45  //行列aの動的確保
46  a = malloc(sizeof(int)*n);
47  for (i =0; i < n; i++){
48    a[i] = malloc(sizeof(int)*n);
49  }
50  //ベクトルxの動的確保
51  x = malloc(sizeof(int)*n);
52  printf("a[2][2] = %d\n",a[2][2]); //ここでエラーが出ないので確保はできてる
53  //値の埋め込み
54
55  int k = 0; //行数カウンター
56  f_in = fopen(f_in_name,"r"); //ポインタのリセット
57  while( fgets(lin,40,f_in) != NULL)
58  {
59    len = strlen(lin);
60    //printf("lin = %slen = %d\n",lin,len);
61    int l = 0; //列数
62    if(k <= n){ //行列aへの代入条件
63
64      for (i=0;i<len;i++) //行内での文字判定
65      {
66        if(lin[i]==','){
67          continue; //区切り文字ならループを回す
68        }
69        printf("%d,%dに代入します\n",k,l);
70        a[k][l] = atoi(&lin[i]); //問題の箇所
71        printf("a[%d][%d] = %d\n",k,l,a[k][l]);
72        l++;
73        if(l==n)
74          break;
75      }
76    }
77    else{ //ベクトルxへの代入条件
78      x[k-n] = atoi(&lin[0]);
79      printf("x[%d] = %d",k-n,x[k-n]);
80    }
81    k++;
82  }
83  printf("k = %d\n",k);
84  for(i=0;i<n;i++){
85    for(int j=0;j<n;j++){
86      printf("a[%d][%d]=%d\n",i,j,a[i][j]);
87    }
88  }
89
90}
91

##input.txt

txt
11,2,3
23,4,5
35,4,3
45
56
67

##実行結果

terminal
1サイズ n = 3
2a[2][2] = 0
30,0に代入します
4a[0][0] = 1
50,1に代入します
6a[0][1] = 2
70,2に代入します
8a[0][2] = 3
91,0に代入します
10a[1][0] = 3
111,1に代入します
12a[1][1] = 4
131,2に代入します
14a[1][2] = 5
152,0に代入します
16Segmentation fault: 11