直接の回答ではないですが、レスが付かないようですので一言二言・・・
de_flag=trueになっている行を全て削除したいのですが、
de_flag=true とは具体的に何なのか不明なので、それをベースにしてピンポイントな回答はできませんが、
FilterではなくDatagridview上から完全に削除したいです。
最終的な目的はその先にあって、削除した結果を SQL Server などの DB に反映(更新)したいということでしょうか?
そういう話ではないということでしたら、以下はスルーしてください。
そういう話であるということなら、一度 Visual Studio のウィザードを使って定番の構成のアプリを作ってみてはいかがでしょう?
DataGridView を UI として非接続型のデータ更新を行う場合は、
DataGridview ⇔ BindingSource/BindingNavigator ⇔ DataSet/DataTable ⇔ DataAdapter ⇔ DB
と言う構造にするのが普通です。
以下の記事の「非接続型のデータ更新」のセクションの図1と図2を見てください。見るのはとりあえず図だけでいいです。興味が湧いたら説明も読んでください。
DB 設計者のための明解 ADO.NET 第 1 回
https://docs.microsoft.com/ja-jp/previous-versions/cc482903(v=msdn.10)
上のような構造にすれば、ユーザーが DataGridView を操作した結果は図1にあるように DataSet / DataTable に反映されます。もちろん削除の結果もです。
編集作業が終了後、ユーザーが更新ボタンをクリックすれば、図2のように DataAdapter によって SQL が自動発行され、SQL Server のテーブルが更新されます。
DB が SQL Server の場合ですが、以下のチュートリアル、
10 行でズバリ !! 非接続型のデータ アクセス (ADO.NET) (C#)・・・VB.NET 版の記事もあります
https://code.msdn.microsoft.com/windowsdesktop/10-ADONET-C-cbfe7688
のように Visual Studio のデータソース構成ウィザードを利用して型付 DataSet + TableAdapter を作って、それを利用してアプリを作ると、上に書いた、
DataGridview ⇔ BindingSource/BindingNavigator ⇔ DataSet/DataTable ⇔ DataAdapter ⇔ DB
と言う構造、すなわち以下のページの図のような構造のアプリが、ほとんど自分でコードを書くこと無しに作れます。
Windows フォーム アプリケーションでのデータへの接続
https://docs.microsoft.com/ja-jp/previous-versions/wxt2cwcc(v=vs.120)
上に紹介したチュートリアルは 2 つのテーブルを階層更新するために少々複雑になっていますが、単一テーブルですともっと簡単で、操作に慣れると以下のようなアプリが 5 分もかからず作れるはずです。
削除は、上の画像で、削除する行を選んで×マークのアイコンをクリックするだけで DataGridView からその項目が消えて、内部の DataTable には図1でいう Deleted マークがつきます。その後、フロッピーディスクのアイコンをクリックすれば SQL Server のテーブルに削除を含む編集結果が反映されます。
自力で一からコードを書く場合のような種々の問題に悩むことはなくなり、開発工数は激減するはずです。保守工数も減るはずです。
お試しください。