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pythonでall the input arrays must have same number of dimensionsエラーが発生します。

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前提・実現したいこと

気象情報をNASAのHPから取得し、地図を描画、csv出力するコードです。
拡張子nsのファイルをダウンロード後、下記のpythonのプログラムを通してmapを描画、csvファイル出力を試みていますが、下記エラーが発生します。

発生している問題・エラーメッセージ

Traceback (most recent call last):
  File "ISS_LIS_FlashLoc_Quickview2.py", line 66, in <module>
    flash_event_time = np.concatenate([flash_event_time,time_result])
ValueError: all the input arrays must have same number of dimensions


どうやら同じ次元の配列にしないとconcatenate出来ないということみたいです。。どう解決すれば良いでしょうか?
問題の

flash_event_time = np.concatenate([flash_event_time,time_result])


という部分ですが、time_resultは7487284.33333のようなfloat型であるはずで、flash_event_timeは空配列のはずなんですが。。。

ソースコード

ISS_LIS_FlashLoc_Quickview2.py

# -*- coding: utf-8 -*-

#### Import Python packages ####
import numpy as np
import glob
from netCDF4 import Dataset
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.basemap import Basemap
import csv
try:
    # Python 2
    from itertools import izip
except ImportError:
    # Python 3
    izip = zip
import datetime

default_time = datetime.datetime(1993, 1, 1, 00, 00, 00)

#Define the file directories
dataDir = '/Users/hoge/projects/sxsw2019/NASA_challenge/nc/20180104/' #File path where ISS LIS data are stored
csvfile = "/Users/hoge/projects/sxsw2019/NASA_challenge/csv/isslis_flashloc_test.csv" #File path and name of CSV file

#Identify all NetCDF files in the directory
files = glob.glob(dataDir+'*.nc')

#Create empty arrays to populate lightning flash location coordinates
flash_lat = np.array([]) 
flash_lon = np.array([]) 
flash_event_time = np.array([])


#Loop through list of NetCDF files, for each file, extract the lightning flash latidude
#and longitude, and add to the respective empty array (flash_lat and flash_lon)
for i in files:
    datafile = Dataset(i)

    flash_lat = np.concatenate([flash_lat,datafile.variables['lightning_flash_lat'][:]]) #add to array
    flash_lon = np.concatenate([flash_lon,datafile.variables['lightning_flash_lon'][:]]) #add to array

    input_time = datafile.variables['lightning_event_TAI93_time']
    time = input_time[0]
    time_result = default_time + datetime.timedelta(seconds = float(time))

    flash_event_time = np.concatenate([flash_event_time,time_result])

#Create CSV files of values from the populated flash_lat/lon arrays
with open(csvfile, 'w') as myfile:
    writer = csv.writer(myfile)
    writer.writerows(izip(["flash_lat"], ["flash_lon"], ["flash_event_time"])) #Define headers in row (izip creates columns)
    writer.writerows(izip(flash_lat,flash_lon,flash_event_time)) #Define data rows (izip creates columns)


#Create plot of lightning flash location heat map
plt.figure(figsize=((20,20))) #Set plot dimensions
map = Basemap(projection='cyl', lon_0 = 0, resolution='c')
lightning = map.hexbin(flash_lon, flash_lat, gridsize=300,bins='log',cmap='jet',mincnt=1,zorder=10) #Bin flash counts into hexbins using a gridsize of your choice

#Draw geographic boundaries and meridians/parallels
map.drawmapboundary(fill_color='k')
map.fillcontinents(color='grey',lake_color='grey')
map.drawcoastlines(color='white')
map.drawcountries(color='white')
map.drawmeridians(np.arange(0,390,30), labels=[0,0,0,1],fontsize=10, color="lightgray")
map.drawparallels(np.arange(-90,120,30), labels=[1,0,0,0],fontsize=10, color="lightgray")

cbar = map.colorbar(lightning,location='bottom',pad="5%")
cbar.set_label('Flash Count') #Remember to change label

plt.title('ISS LIS Detected Lightning Flash Locations January 4, 2018', fontsize = 18) #Rember to change title


plt.show()
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  • Daimian

    2019/02/06 14:04

    またまた迅速なご回答ありがとうございます。
    最終的に、 writer.writerows(izip(flash_lat,flash_lon,flash_event_time)) という項目でcsvファイルに記述しますので、flash_event_time配列にtime_resultを追加したいです!

    キャンセル

  • tiitoi

    2019/02/06 14:12 編集

    CSVデータがないので、こちらでは検証はできないのですが
    今回のケースですと、numpy 配列に拘る必要はないように思えます。通常のリストに情報を詰めていって、出力してみてはどうでしょうか?

    http://pynote.hatenablog.com/entry/python-csv-io-recipe#%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%83%88%E3%82%92-CSV-%E3%81%AB%E4%BF%9D%E5%AD%98%E3%81%99%E3%82%8B

    キャンセル

  • Daimian

    2019/02/06 16:54

    色々と迅速なご対応誠にありがとうございます!確かにおっしゃる通りnumpy配列にこだわり必要はございませんでした。通常の配列に格納し、実装を行いました。誠にありがとうございます!

    キャンセル

回答 1

checkベストアンサー

+1

flash_event_time配列に時間情報time_resultを追加するのであれば、

flash_event_time.append(time_result)

でよろしいかと。

https://qiita.com/AfricaUmare/items/22de1ca413176e4a19a6

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  • 2019/02/06 16:53

    ご指摘の通り、numpyを使用せずに通常の配列で実装しました。ありがとうございます

    キャンセル

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