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MySQL

MySQL(マイエスキューエル)は、TCX DataKonsultAB社などが開発するRDBMS(リレーショナルデータベースの管理システム)です。世界で最も人気の高いシステムで、オープンソースで開発されています。MySQLデータベースサーバは、高速性と信頼性があり、Linux、UNIX、Windowsなどの複数のプラットフォームで動作することができます。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

解決済

SQLAlchemyからSSHでEC2の踏み台サーバを経由してAWS RDSのデータを参照したい。

ScenesK7
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総合スコア10

MySQL

MySQL(マイエスキューエル)は、TCX DataKonsultAB社などが開発するRDBMS(リレーショナルデータベースの管理システム)です。世界で最も人気の高いシステムで、オープンソースで開発されています。MySQLデータベースサーバは、高速性と信頼性があり、Linux、UNIX、Windowsなどの複数のプラットフォームで動作することができます。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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投稿2018/12/16 10:14

編集2018/12/17 05:27

前提・実現したいこと

ここに質問の内容を詳しく書いてください。
SQLAlchemy(Dockerコンテナ内で実行)からAWS RDSのデータを参照しようとしています。
SSHでEC2の踏み台サーバを通してDB(MySQL)サーバのデータを取得しようとしたときにエラーが発生します。

発生している問題・エラーメッセージ

sqlalchemy.exc.OperationalError: (_mysql_exceptions.OperationalError) (2006, "Can't connect to MySQL server on 'DB_HOST' (111)") (Background on this error at: http://sqlalche.me/e/e3q8)

該当のソースコード

Dockerfile

FROM ubuntu:16.04 USER root ENV HOME=/root ARG PYTHON_VERSION=3.6.7 ARG PYTHON_ROOT=$HOME/local/python-$PYTHON_VERSION ENV PATH=$PYTHON_ROOT/bin:$PATH ARG PYENV_ROOT=$HOME/.pyenv RUN apt-get update && apt-get -y upgrade RUN apt-get -y install \ git \ make \ build-essential \ libssl-dev \ zlib1g-dev \ libbz2-dev \ libreadline-dev \ libsqlite3-dev \ wget \ curl \ llvm \ libncurses5-dev \ libncursesw5-dev \ xz-utils \ tk-dev \ libffi-dev \ liblzma-dev RUN git clone https://github.com/pyenv/pyenv.git ~/.pyenv RUN $PYENV_ROOT/plugins/python-build/install.sh RUN /usr/local/bin/python-build -v $PYTHON_VERSION $PYTHON_ROOT RUN rm -rf $PYENV_ROOT RUN pip install --upgrade pip RUN /bin/bash -c "debconf-set-selections <<< 'mysql-server mysql-server/root_password password MY_PASSWORD'" && \ /bin/bash -c "debconf-set-selections <<< 'mysql-server mysql-server/root_password_again password MY_PASSWORD'" && \ apt install -y mysql-server libmysqlclient-dev VOLUME /var/run/mysqld COPY bash_profile /root/.bash_profile RUN pip install sshtunnel mysqlclient sqlalchemy RUN pip install pandas ARG WORKDIR=$HOME/app VOLUME $WORKDIR WORKDIR $WORKDIR

bash

# bash_profile touch /var/run/mysqld/mysqld.sock chown -R mysql:mysql /var/run/mysqld /var/lib/mysql service mysql start chmod 600 ./.ssh/*
$ docker run -v $(pwd):/root/app -it IMAGE_NAME bash --login

db.py

from sshtunnel import SSHTunnelForwarder import sqlalchemy import pandas as pd SSH_HOST = 'SSH_HOST_IP' SSH_PORT = 22 SSH_HOST_KEY = None SSH_USERNAME = 'ec2-user' SSH_PASSWORD = None SSH_PKEY = './.ssh/my.pem' DB_HOST = 'hoge.rds.amazonaws.com' REMOTE_BIND_ADDRESS = (DB_HOST, 3306) DB_USER = 'DB_USERNAME' DB_PASSWORD = 'DB_PASSWORD' DB_PORT = 3306 DB_NAME = 'db' with SSHTunnelForwarder(SSH_HOST, SSH_PORT, ssh_host_key=SSH_HOST_KEY, ssh_username=SSH_USERNAME, ssh_password=SSH_PASSWORD, ssh_pkey=SSH_PKEY, remote_bind_address=REMOTE_BIND_ADDRESS) as server: con = sqlalchemy.create_engine( f'mysql+mysqldb://{DB_USER}:{DB_PASSWORD}@{DB_HOST}:{DB_PORT}/{DB_NAME}') data = pd.read_sql('SQL_QUERY', con)

試したこと

コンテナ内のMySQLにrootユーザーでログインはできます。
コマンドラインから直接リモートDBにアクセスするのは、方法がよくわからないため試せていません。

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

ここにより詳細な情報を記載してください。

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