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sourcetreeで 「更新していない」けど「更新したファイル」になる

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sourcetreeを使ってソースを管理しています。
外部で更新されたソースをダウンロードして、ローカルにある既存ソースに対して上書き保存をしました。

”更新されたいファイル”のみsourcetreeで差分チェックできると思ったのですが、
下記のように「中身は同じ」でも更新されたファイルとして表示されます。
これが数千も表示されてしまうので管理がままなりません。

これは何が原因で、どのように対処すればよろしいでしょうか?
イメージ説明
更新された部分があるところは正常に差分が表示されています。

よろしくお願いします。

【追記】
利用環境:
Mac  OS X Yosemite 10.10.5
SourceTree 2.0.5.2

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  • 2015/09/14 13:44 編集

    ※このコメント内容は間違いと判明しましたm(_ _)m
    ありがとうございます。
    sourcetreeから変更を「破棄」をして見ました。
    しかしながら、ファイル情報を見る限りパーミッション(読み書き)に変化はなく、ファイルサイズなども1バイト変化しない状態です。

    キャンセル

  • 2015/09/14 13:56

    すみません。先ほど git diff でチェックしてみたところリンク先と同じく
    old mode 100644
    new mode 100755
    と表示されました。

    キャンセル

  • 2015/09/14 13:59

    ターミナルで 
    git config core.filemode false
    を入力することで解決しました。
    ありがとうございます。

    キャンセル

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候補1:ファイル名の大文字小文字だけが変わってしまった
http://shogo82148.github.io/blog/2014/10/21/git-case-sensitivity/

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  • 2015/09/14 13:42

    ありがとうございます。
    ファイル名の変更は無いようです。
    しかしながら、この問題はありそうですね。

    キャンセル

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