indexの設定がうまくいかない

 前提・実現したいこと

決定木分析のために下記URLのページから以下のコードを実行したところ、エラーとなりました。
https://algorithm.joho.info/machine-learning/python-scikit-learn-decision-tree/

 入力したコード

import pandas as pd
from sklearn import tree

def main():
data = pd.read_csv("data.csv", sep=",")
variables = ['x1', 'x2']
clf = tree.DecisionTreeClassifier()
clf = clf.fit(data[variables], data['x3'])
with open('graph.dot', 'w') as f:
f = tree.export_graphviz(clf, out_file=f)
if name == "main":
main()

 発生している問題・エラーメッセージ

KeyError                                  Traceback (most recent call last)
<ipython-input-56-994f00b2b08b> in <module>()
     21 
     22 if __name__ == "__main__":
---> 23     main()

<ipython-input-56-994f00b2b08b> in main()
     14 
     15     # 分類器にサンプルデータを入れて学習(目的変数はx）
---> 16     clf = clf.fit(data[variables], data['x3'])
     17 
     18     # 学習結果を出力

~\Anaconda3\lib\site-packages\pandas\core\frame.py in __getitem__(self, key)
   2677         if isinstance(key, (Series, np.ndarray, Index, list)):
   2678             # either boolean or fancy integer index
-> 2679             return self._getitem_array(key)
   2680         elif isinstance(key, DataFrame):
   2681             return self._getitem_frame(key)

~\Anaconda3\lib\site-packages\pandas\core\frame.py in _getitem_array(self, key)
   2721             return self._take(indexer, axis=0)
   2722         else:
-> 2723             indexer = self.loc._convert_to_indexer(key, axis=1)
   2724             return self._take(indexer, axis=1)
   2725 

~\Anaconda3\lib\site-packages\pandas\core\indexing.py in _convert_to_indexer(self, obj, axis, is_setter)
   1325                 if mask.any():
   1326                     raise KeyError('{mask} not in index'
-> 1327                                    .format(mask=objarr[mask]))
   1328 
   1329                 return com._values_from_object(indexer)

KeyError: "['x1' 'x2'] not in index"

 試したこと

ここに問題に対して試したことを記載してください。

 補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

csvの中身です

x1,x2,x3
45,17.5,30
38,17.0,25
41,18.5,20
34,18.5,30
59,16.0,45
47,19.0,35
35,19.5,25
43,16.0,35
54,18.0,35
52,19.0,40