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Google ColaboratoryでCSVファイルを読み込めない

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bariko

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データ分析でJupyter notebookではなくGoogle Colaboratoryを使ってみようと思いましたが、
同じディレクトリにあるはずのCSVファイルが読み込めません。

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
data=np.loadtxt('test.csv',delimiter=",",skiprows=1)
---------------------------------------------------------------------------
OSError                                   Traceback (most recent call last)
<ipython-input-2-332b4cbb84f6> in <module>()
----> 1 data=np.loadtxt('test.csv',delimiter=",",skiprows=1)

/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/numpy/lib/npyio.py in loadtxt(fname, dtype, comments, delimiter, converters, skiprows, usecols, unpack, ndmin, encoding)
    915             fname = str(fname)
    916         if _is_string_like(fname):
--> 917             fh = np.lib._datasource.open(fname, 'rt', encoding=encoding)
    918             fencoding = getattr(fh, 'encoding', 'latin1')
    919             fh = iter(fh)

/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/numpy/lib/_datasource.py in open(path, mode, destpath, encoding, newline)
    258 
    259     ds = DataSource(destpath)
--> 260     return ds.open(path, mode, encoding=encoding, newline=newline)
    261 
    262 

/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/numpy/lib/_datasource.py in open(self, path, mode, encoding, newline)
    614                                       encoding=encoding, newline=newline)
    615         else:
--> 616             raise IOError("%s not found." % path)
    617 
    618 

OSError: test.csv not found.

ls
datalab/


datalab/という謎ファイルが入っていることは確認できますが、同じディレクトリにはもっとたくさんのファイルが存在するのに出てきません。

https://qiita.com/yoshizaki_kkgk/items/bf01842d1a80c0f9e56c

こちらの記事に載っている方法でCSVファイルは読み込めたのですが、Google Colaboratoryではデータ分析をするたびにこの処理をしなければいけないのでしょうか?

もし、Jupyter notebookの様に簡単に読み込む方法をご存知の方がいらっしゃいましたらご教授をお願い致します。

イメージ説明
こちら実行してもずっと実行中のまま動きません。
入れたいCSVファイルはGoogleドライブのマイドライブ/Colab Notebooksの中にnotebookと一緒に入っている状態です。CSVファイルの置き場所が悪いのでしょうか。。

いつまでもぐるぐるして実行中のままなのでストップさせるとこんなエラーが出ました。
イメージ説明

---------------------------------------------------------------------------
TypeError                                 Traceback (most recent call last)
<ipython-input-8-148faebd74fe> in <module>()
      1 from google.colab import files
----> 2 upload = files.upload()
      3 import pandas as pd
      4 import io
      5 df = pd.read_csv('sample.csv', header=-1)

/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/google/colab/files.py in upload()
     65   local_filenames = dict()
     66 
---> 67   while result['action'] != 'complete':
     68     result = output.eval_js(
     69         'google.colab._files._uploadFilesContinue("{output_id}")'.format(

TypeError: 'NoneType' object is not subscriptable
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  • wakame

    2018/08/09 21:17

    lsしてdatalab/しか表示されないのであればtest.csvはカレントディレクトリ直下にないということではないのですか

    キャンセル

  • bariko

    2018/08/11 09:19

    ローカルならわかりますが、googleドライブ上でカレントディレクトリ直下に入れる入れ方がわかりません。マイドライブ/Colab notebookの中にnotebookそのものとcsvの全て入っていますが、これでは不十分ということでしょうか?

    キャンセル

回答 3

check解決した方法

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単にsafariでやってることが問題だった様です。
chromeからやったらあっさり出来ました!
お騒がせしました〜!!!

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これでどこからでもアクセスできます

from google.colab import files
upload = files.upload() 
import pandas as pd
import io
df = pd.read_csv('sample.csv', header=-1)
df.head()


イメージ説明

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  • 2018/08/11 09:17

    これを叩いても実行中のままで次に進まないです。
    ずっとぐるぐるしてます。
    どうしてでしょうか?

    キャンセル

  • 2018/08/11 11:08 編集

    ん~一応自分の環境だといけるんやけど。なんかpipしてないとかかなぁ
    はった画像みたいになるんだけどね

    キャンセル

  • 2018/08/11 11:24

    ちなみに↓これってローカルにあるファイルをインポートするやり方ですよね?
    from google.colab import files
    upload = files.upload()
    import pandas as pd
    import io
    df = pd.read_csv('sample.csv', header=-1)
    df.head()

    キャンセル

  • 2018/08/11 11:25

    そうですよ

    キャンセル

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