Unityで生成したXcodeで64bitビルドを行うとNativeのC++でApple Match -O Linker Error

Unityから生成したXcodeでビルドするとリンカエラーが発生し解決できずに悩んでおります。

もともとAppStoreでリリース済みのアプリで32bitでビルドはできておりますが、64bitの審査が義務付けられたことによって今回アップデートのタイミングで64bit対応アプリをリリースする必要があります。

ただ、以下の手順で64bitビルドを行うと大量のリンカエラーが発生しビルドが通らない状況です。

【エラー内容】
Undefined symbols for architecture arm64:
  "_UP_SKView_presentScene_transition_", referenced from:
      _SKView_UP_SKView_presentScene_transition__m20915 in Bulk_U3DXTSpriteKit_0.o
     (maybe you meant: _SKView_UP_SKView_presentScene_transitionm20915, _SKView_UP_SKView_presentScene_transitionm20915_MethodInfo )

  "_UP_SKView_convertPoint_toScene_", referenced from:
      _SKView_UP_SKView_convertPoint_toScene__m20913 in Bulk_U3DXTSpriteKit_0.o
     (maybe you meant: _SKView_UP_SKView_convertPoint_toScenem20913, _SKView_UP_SKView_convertPoint_toScenem20913_MethodInfo )

  "_UP_SKView_set_showsNodeCount", referenced from:
      _SKView_UP_SKView_set_showsNodeCount_m20911 in Bulk_U3DXTSpriteKit_0.o
     (maybe you meant: _SKView_UP_SKView_set_showsNodeCount_m20911, _SKView_UP_SKView_set_showsNodeCount_m20911_MethodInfo )

・・・以下MAX200件エラーが出てビルドが止まります。
Classes/NativeのC++ソースの生成オブジェクトでリンクエラーが発生している模様です。

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《環境》Unity：v4.6.5f1
Xcode： 6.4


《Unity設定》
下記の設定で64bitビルド用のプロジェクト生成

File > Build Settings... ➡︎ iOS > Player Settings...

Scripting Backend：IL2CPP
Architecture：universal


《Xcode設定》
Targets > Build Settings

Architectures：Standard architectures（armv7, arm64）- $(ARCHS_STANDARD)
Build Active Architecture Only：No
Valiid Architectures：arm64 armv7s armv7


《備考》
・armv7のみ（32bti）でビルドするとビルドが完了し、正常にアプリが動作することは確認しました。
・リンカエラーが発生しているのは生成したNativeのC++ソースのオブジェクトです。

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Unity側は以下のような64bitビルド用設定記事を参考に対応しました。

UnityのiOS 64bitビルド
http://qiita.com/dsgarage/items/3f1483b19ac0feab4473


どなたか思いたることがあれば些細なことで構いませんのでご回答頂けると助かります。