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Pythonで RuntimeWarning: divide by zero encountered in log -infのエラー

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gymgym

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Pythonを用いてウィシャート分布を得たいと考えています

import pandas as pd
import numpy as np
import os
import math
import matplotlib.pyplot as plt
from scipy import arange, float64
from scipy.linalg import det
from scipy.special import digamma

def wishart(D, v_k, W):
    arr = float64(v_k + 1 - arange(1,D)) / 2
    return digamma(arr).sum() + D * np.log(2)+ np.log(det(W))

N=29
# 平均ベクトル
row_sum = np.sum(data, axis=0)
x_ave = row_sum/N

#分散
S = np.cov(data, rowvar=1, bias=1)

b0 = 0.1
m0 = 0
α = 0.1
W = np.eye(500)*α
v0 = 500

a1 = x_ave - m0
a2 = a1.T
b_k = b0 + N
m_k = 1/b_k*(b0*m0 + N*x_ave)
Wk_inverse = np.linalg.inv(W) + N*S + (b0*N/b0+N)* np.dot(a1,a2)


以上のコードで

 RuntimeWarning: divide by zero encountered in log  -infのエラー 


このようなエラーがでます

np.log(det(W))


この部分でlogに0が入っているみたいなのですが、0が入っているか確かめる方法はありますか。

また、0が入っているというエラーではなかったらどのようなことが原因でしょうか

よろしくお願い致します

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回答 4

+2

前以て行列の階数を調べておけばいいんじゃないでしょうか。

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+1

det(W)が0になっているということですね。det(W)の結果が浮動小数点になると思うのでちょっと危なっかしいですが、if det(W) == 0:で捕まえられんじゃないでしょうか。

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+1

上記のコードではwishartがコールさていませんが、関係ないものということでしょうか?

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  • 2018/05/16 18:37

    あら、ホントだ。

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  • 2018/05/17 09:56

    申し訳ございません。抜けてました。

    キャンセル

+1

... この部分でlogに0が入っているみたい ...

まずは、
print(W)
orint(det(W))
を追加して、値を確認してもみるとよいです。

W の内容が正しいものだとしたら、 det(W) が 0 のときは、 log をしないようにコードを修正すればよいです。
W のないようが想定しているものでなければ、W を計算してい部分をもなおしていく...
というように、確認・修正を繰返してみてください。

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  • 2018/05/17 08:27

    orint

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