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PythonのPandasを用いたランダムフォレストのエラー

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asoaso

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X = features_df.ix[:, 1:]
y = features_df['labels']

# 学習データとテストデータの分離
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, random_state=0)

# ランダムフォレストの作成
forest = RandomForestClassifier(min_samples_leaf=3, random_state=0)
forest.fit(X_train, y_train)


以上のコードを実行したところ、

Traceback (most recent call last):
  File "zyan07.py", line 85, in <module>
    forest.fit(X_train, y_train)
  File "/Users/anaconda/lib/python3.6/site-packages/sklearn/ensemble/forest.py", line 247, in fit
    X = check_array(X, accept_sparse="csc", dtype=DTYPE)
  File "/Users/anaconda/lib/python3.6/site-packages/sklearn/utils/validation.py", line 382, in check_array
    array = np.array(array, dtype=dtype, order=order, copy=copy)
ValueError: setting an array element with a sequence.


以上のような要素の数が合わない時にでるエラーがでました。
しかし、

# fetures_df
    labels                                                  1  \
0        0  [2.97824915877e-05, 2.80212722019e-05, 3.12427...   
1        1  [2.90123477039e-05, 3.26028408553e-05, 1.48843...   
2        1  [2.56926697949e-05, 1.79988710521e-05, 1.01435...   
3        2  [2.71302874928e-05, 3.19039861701e-05, 2.89806...   
4        0  [4.83277936431e-05, 4.33511629455e-05, 6.40456...   
5        2  [3.493801307e-05, 4.16113943935e-05, 3.8435169...   
6        2  [2.3777129164e-05, 1.35680704131e-05, 2.270679...   
7        1  [5.46208761299e-06, 1.08878124966e-05, 1.26878...   
8        0  [1.63636161029e-05, 2.62342199006e-05, 2.63173...   
9        2  [4.03476453555e-05, 3.95290569071e-05, 3.19161...   
10       1  [3.00297221501e-05, 2.9226245877e-05, 4.221138...   
11       2  [3.25128782391e-05, 3.35083535783e-05, 3.48355...   
12       1  [2.47604797997e-05, 2.05030698413e-05, 1.51778...   
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16       1  [2.12201183706e-05, 2.82715382307e-05, 4.04773...   
17       0  [3.67945591969e-05, 1.42523043633e-05, 1.86241...   

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14  [3.820040599e-05, 2.23325608667e-05, 4.0332071...   
15  [2.34477193999e-05, 4.10953684999e-05, 2.07690...   
16  [3.61796125834e-05, 2.74565877756e-05, 3.00205...   
17  [1.95650644988e-05, 1.3418310591e-05, 3.271473...   

                                                    8  
0   [3.26888591774e-05, 6.22149920978e-05, 2.08512...  
1   [2.13746239841e-05, 2.91717897e-05, 1.67848268...  
2   [1.58193353842e-05, 2.71193400762e-05, 1.61646...  
3   [2.0520418166e-05, 1.19986974799e-05, 1.036316...  
4   [2.66489577213e-05, 4.87720734369e-05, 1.57340...  
5   [3.29022848666e-05, 1.5961953446e-05, 3.238837...  
6   [3.76601374543e-05, 4.2154100685e-05, 3.329790...  
7   [4.48956882478e-05, 1.92541886099e-05, 2.72667...  
8   [3.91631249753e-05, 3.08750700914e-05, 3.78819...  
9   [1.37154664548e-05, 3.15028994829e-05, 5.10265...  
10  [3.33259361327e-05, 2.17747571578e-05, 1.94077...  
11  [2.63040179548e-05, 2.97797667698e-05, 1.08294...  
12  [1.16931762214e-05, 9.09241285619e-06, 1.53440...  
13  [5.22224859999e-05, 4.74381585432e-05, 4.77211...  
14  [2.66505307685e-05, 2.84150621355e-05, 4.48780...  
15  [1.70663508688e-05, 4.55365831797e-05, 3.82321...  
16  [5.79364263998e-05, 2.1250424711e-05, 2.724971...  
17  [4.10983437211e-05, 1.33443850831e-05, 4.28582... 


このようにfeature_dfの要素数は揃っています。
原因はどこに考えられるでしょうか。

よろしくお願い致します。

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回答 1

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'X_train.shape'はどうなっていますか?

len(fetures_df.iloc[0, '1']) == len(fetures_df.iloc[0, '2']) == ...になっている必要があります。


a = np.array([np.arange(2), np.arange(3)])
print(a)
#[array([0, 1]) array([0, 1, 2])]
print(a.shape)
#(2,)

a = np.array([np.arange(3), np.arange(3)])
print(a)
'''
[[0 1 2]
 [0 1 2]]
'''
print(a.shape)
#(2, 3)

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  • 2018/01/09 12:36

    回答ありがとうございます。
    使用するデータを変更しても同じエラーが出ました。
    X_train.shapeは、(18、8)です。

    キャンセル

  • 2018/01/09 12:55

    試しに
    X = features_df.ix[:, 1]
    としてもエラーになりますか?

    次元が1つ落ちているので、
    len(fetures_df.iloc[0, '1']) == len(fetures_df.iloc[0, '2']) == ...
    が満たされていません。

    キャンセル

  • 2018/01/09 13:29

    X = features_df.ix[:, 1]にしてもエラーになります。

    print(len(features_df.iloc[0, '1']))を実行すると、
    Traceback (most recent call last):
    File "game01.py", line 71, in <module>
    print(len(features_df.iloc[0, '1']))
    File "/Users/anaconda/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/indexing.py", line 1325, in __getitem__
    return self._getitem_tuple(key)
    File "/Users/anaconda/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/indexing.py", line 1662, in _getitem_tuple
    self._has_valid_tuple(tup)
    File "/Users/anaconda/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/indexing.py", line 191, in _has_valid_tuple
    "types" % self._valid_types)
    ValueError: Location based indexing can only have [integer, integer slice (START point is INCLUDED, END point is EXCLUDED), listlike of integers, boolean array] types

    以上のようなエラーがでます。

    キャンセル

  • 2018/01/09 13:48

    print(len(features_df.iloc[0, 1]))にしてみてください。

    キャンセル

  • 2018/01/10 12:05

    データの方に不具合があり、修正することでうまくいきました。
    丁寧にアドバイスしてくださりありがとうございます。
    今後ともよろしくお願い致します。

    キャンセル

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