MybatisでMysqlの接続ができない

Dockerを使って、SpringbootとMysqlのコンテナを立ち上げ、MybatisでDB接続しようとしています。
DB接続を試しにサンプルで実行してみようとこのこのサイトを参考にソースを書いて、実行したのですが、DBから情報を取得するところでエラーが出ます。

apprivcation.propertiesの設定やdocker-compose,build.gradleなどの設定を何度も見返しましたが、
原因がわかりませんでした。
teratailなどで同様のエラーを見つけたのですが、apprication.propertiesの設定ミスが多いかったのですが、エラーを見つけることができませんでした。
一週間悩み続けても解決できず、今回投稿させていただきました。
すみませんが、ご教授いただければ幸いです。
よろしくお願いします。

エラーメッセージ

Whitelabel Error Page
This application has no explicit mapping for /error, so you are seeing this as a fallback.

Sun Sep 11 02:21:35 UTC 2022
There was an unexpected error (type=Internal Server Error, status=500).
nested exception is org.apache.ibatis.exceptions.PersistenceException: ### Error querying database. Cause: org.springframework.jdbc.CannotGetJdbcConnectionException: Failed to obtain JDBC Connection; nested exception is com.mysql.cj.jdbc.exceptions.CommunicationsException: Communications link failure The last packet sent successfully to the server was 0 milliseconds ago. The driver has not received any packets from the server. ### The error may exist in com/example/demo/dao/BookDao.xml ### The error may involve com.example.demo.dao.BookDao.findAll ### The error occurred while executing a query ### Cause: org.springframework.jdbc.CannotGetJdbcConnectionException: Failed to obtain JDBC Connection; nested exception is com.mysql.cj.jdbc.exceptions.CommunicationsException: Communications link failure The last packet sent successfully to the server was 0 milliseconds ago. The driver has not received any packets from the server.
org.mybatis.spring.MyBatisSystemException: nested exception is org.apache.ibatis.exceptions.PersistenceException: 
### Error querying database.  Cause: org.springframework.jdbc.CannotGetJdbcConnectionException: Failed to obtain JDBC Connection; nested exception is com.mysql.cj.jdbc.exceptions.CommunicationsException: Communications link failure

The last packet sent successfully to the server was 0 milliseconds ago. The driver has not received any packets from the server.
### The error may exist in com/example/demo/dao/BookDao.xml
### The error may involve com.example.demo.dao.BookDao.findAll
### The error occurred while executing a query
### Cause: org.springframework.jdbc.CannotGetJdbcConnectionException: Failed to obtain JDBC Connection; nested exception is com.mysql.cj.jdbc.exceptions.CommunicationsException: Communications link failure

The last packet sent successfully to the server was 0 milliseconds ago. The driver has not received any packets from the server.
	at org.mybatis.spring.MyBatisExceptionTranslator.translateExceptionIfPossible(MyBatisExceptionTranslator.java:96)
	at org.mybatis.spring.SqlSessionTemplate$SqlSessionInterceptor.invoke(SqlSessionTemplate.java:441)
	at jdk.proxy2/jdk.proxy2.$Proxy57.selectList(Unknown Source)
	at org.mybatis.spring.SqlSessionTemplate.selectList(SqlSessionTemplate.java:224)
	at org.apache.ibatis.binding.MapperMethod.executeForMany(MapperMethod.java:147)
	at org.apache.ibatis.binding.MapperMethod.execute(MapperMethod.java:80)
	at org.apache.ibatis.binding.MapperProxy$PlainMethodInvoker.invoke(MapperProxy.java:145)
	at org.apache.ibatis.binding.MapperProxy.invoke(MapperProxy.java:86)
	at jdk.proxy3/jdk.proxy3.$Proxy59.findAll(Unknown Source)
	at com.example.demo.service.BookService.getBookList(BookService.java:23)
	at com.example.demo.controller.BookController.index(BookController.java:32)
	at java.base/jdk.internal.reflect.DirectMethodHandleAccessor.invoke(DirectMethodHandleAccessor.java:104)
	at java.base/java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:577)
	at org.springframework.web.method.support.InvocableHandlerMethod.doInvoke(InvocableHandlerMethod.java:205)
	at org.springframework.web.method.support.InvocableHandlerMethod.invokeForRequest(InvocableHandlerMethod.java:150)
	at org.springframework.web.servlet.mvc.method.annotation.ServletInvocableHandlerMethod.invokeAndHandle(ServletInvocableHandlerMethod.java:117)
	at org.springframework.web.servlet.mvc.method.annotation.RequestMappingHandlerAdapter.invokeHandlerMethod(RequestMappingHandlerAdapter.java:895)
	at org.springframework.web.servlet.mvc.method.annotation.RequestMappingHandlerAdapter.handleInternal(RequestMappingHandlerAdapter.java:808)
	at org.springframework.web.servlet.mvc.method.AbstractHandlerMethodAdapter.handle(AbstractHandlerMethodAdapter.java:87)
(略)

ソースコード

docker
1version: '3.6'
2services:
3  app:
4    container_name: app
5    build:
6      context: .
7      dockerfile: ./docker/java/Dockerfile
8    ports:
9      - 8080:8080
10    tty: true
11    volumes:
12      - ./server:/srv:cached
13    working_dir: /srv
14    command: /bin/bash -c "./gradlew bootRun"
15
16  mysql:
17    image: mysql:5.7
18    container_name: db
19    ports:
20      - 3306:3306
21    volumes:
22      - ./docker/db/mysql:/var/lib/mysql
23      - ./docker/db/initdb:/docker-entrypoint-initdb.d/
24      - ./docker/db/my.cnf:/etc/mysql/conf.d/my.cnf
25    environment:
26      MYSQL_ROOT_PASSWORD: password
27      MYSQL_DATABASE: library
28      MYSQL_USER: user
29      MYSQL_PASSWORD: password
30
31  phpmyadmin:
32    image: phpmyadmin/phpmyadmin
33    container_name: phpmyadmin
34    environment:
35      - PMA_ARBITRARY=1
36      - PMA_HOST=mysql
37      - PMA_USER=root
38      - PMA_PASSWORD=password
39    links:
40      - mysql
41    ports:
42      - 4040:80
43    volumes:
44      - ./docker/phpmyadmin/sessions:/sessions

build.gradle
1dependencies {
2	implementation 'org.springframework.boot:spring-boot-starter-thymeleaf'
3	implementation 'org.springframework.boot:spring-boot-starter-web'
4	implementation 'org.mybatis.spring.boot:mybatis-spring-boot-starter:2.2.2'
5	runtimeOnly 'mysql:mysql-connector-java'
6	compileOnly 'org.projectlombok:lombok'
7	developmentOnly 'org.springframework.boot:spring-boot-devtools'
8	annotationProcessor 'org.projectlombok:lombok'
9	testImplementation 'org.springframework.boot:spring-boot-starter-test'
10}

application.properties
1spring.datasource.url=jdbc:mysql://localhost:3306/library?serverTimezone=JST
2spring.datasource.username=user
3spring.datasource.password=password
4spring.datasource.driver-class-name=com.mysql.cj.jdbc.Driver
5mybatis.configuration.map-underscore-to-camel-case=true
6spring.datasource.initialization-mode=always

Book.java
1package com.example.demo.entity;
2import java.time.LocalDate;
3import lombok.Data;
4
5@Data
6public class Book {
7    private Integer id;
8    private String bookName;
9    private Integer volumeNum;
10    private String authorName;
11    private LocalDate publishedDate;
12
13    public Book (Integer id, String bookName, Integer volumeNum, String authorName,  LocalDate publishedDate) {
14        this.id = id;
15        this.bookName = bookName;
16        this.volumeNum = volumeNum;
17        this.authorName = authorName;
18        this.publishedDate = publishedDate;
19    }
20
21    public Book () {
22
23    }
24}

my.cnf
1[mysqld]
2character-set-server=utf8mb4
3collation-server=utf8mb4_general_ci
4explicit-defaults-for-timestamp=1
5general-log=1
6general-log-file=/var/log/mysql/mysqld.log
7
8[client]
9default-character-set=utf8mb4

試したこと

・こちらのサイトの17番に空のコンストラクタが存在することとあったので、Book.javaにコンストラクタを追加しましたが、エラー内容は変わりませんでした。

・下記のサイトも参考にして、実行しましたが同じエラーが表示されました。
Spring Boot + MyBatisでデータベースに接続する方法
 MyBatisとは？使い方やSpringとの連携方法をサンプル付きで解説！

IT001

2022/09/11 08:52 編集

以下にも書いたのですが、Spring boot 2.7をお使いの場合は、application.propertiesの設定方法が変わっています。 https://teratail.com/questions/51qrox5n19hf55 もし、2.7をお使いの場合は、initialization-mode ⇒ init.modeをご利用ください。

IT001

2022/09/11 15:26

なお、Bookクラスのコンストラクタは、(Lombokの)@AllArgsConstructorと@NoArgsConstructorで簡略化できます。接続エラーなども出ているので、問題の切り分けとして Dockerを使わない状態で動いているのかも確認した方がよろしいかと思います。

ryo012345

2022/09/13 13:22

返信遅くなり申し訳ありません。返信できておりませんでした。いろいろ教えていただきありがとうございます。そもそもschema.sqlを使っておらず、DockerでDBを立ち上げたときにInsertするようにしていました。なので、init.modeに変更してもエラー表示されました。＞Dockerを使わない状態で動いているのかも確認した方がよろしいかと思います。ずっとDockerでやらないとと思っていたのでその発想はありませんでした。。。 2度も回答していただきありがとうございました。試してみたいと思います！

ryo012345

2022/09/13 13:58

Dockerを使わず実行してみるとうまく動作しました。本当にうれしいです！が、Dockerが扱えなかったことが残念です。今回はかなり時間を食ってしまい全然予定通りに進んでいないのでひとまずDockerを使わずに開発進めようと思います。教えてくださりありがとうございました！もっと柔軟な思考を持つべきと気づかされました！

IT001

2022/09/13 14:18

動いて良かったです！一応、Spring BootにはBuildpacksという「Dockerファイルを書かなくても、作れる仕組み」があるので、予定通りに進んで、余裕ができてきた頃にお試しください。 https://tech.excite.co.jp/entry/2022/07/07/173157