前提
Rでデータシートを読み込み、日付の比較をまとめてしたいと思うのですが、処理でつまづいております。
実現したいこと
下記のようなデータフレームがあります。
- subject_id :被験者のID。同じsubject_idが複数回出現する場合があります。
- Reference : 基準となる日付
- Event_1, 2, 3 : イベント日。最低1回(Event_1のみ)〜最大3回(Event_3まで)で、回数にばらつきがあります。
行いたいのは、各行ごとに処理を行い、Event_1 ~ Event_3のうち、
Reference に最も近い日付(Referenceの前か後かは問わない)を求め、新たな列に納めたい、ということです。
該当のソースコード
R言語
1library(tidyverse) 2 3data <- tibble( 4 subject_id = c(1,1,2,3,3,5), 5 Reference = c( 6 lubridate::ymd("2011-1-5"), 7 lubridate::ymd("2013-1-6"), 8 lubridate::ymd("2014-1-7"), 9 lubridate::ymd("2012-1-8"), 10 lubridate::ymd("2013-1-10"), 11 lubridate::ymd("2015-2-4") 12 ), 13 Event_1 = c( 14 lubridate::ymd("2012-1-1"), 15 lubridate::ymd("2012-1-1"), 16 lubridate::ymd("2012-1-7"), 17 lubridate::ymd("2012-1-8"), 18 lubridate::ymd("2012-12-25"), 19 lubridate::ymd("2012-12-25") 20 ), 21 Event_2 = c( 22 lubridate::ymd("2013-1-4"), 23 lubridate::ymd("2013-1-4"), 24 NA_Date_, 25 lubridate::ymd("2011-1-8"), 26 lubridate::ymd("2015-2-1"), 27 lubridate::ymd("2015-2-1") 28 ), 29 Event_3 = c( 30 NA_Date_, 31 NA_Date_, 32 NA_Date_, 33 lubridate::ymd("2011-1-8"), 34 lubridate::ymd("2016-11-10"), 35 lubridate::ymd("2016-11-10") 36 ), 37 ) 38)
試したこと
R言語
1data %>% mutate( 2 diff_1 = abs(Event_1 - Reference), 3 diff_2 = abs(Event_2 - Reference), 4 diff_3 = abs(Event_3 - Reference) ) %>% 5 rowwise() %>% 6 mutate( 7 diff_min = min (diff_1, diff_2, diff_3) 8 ) 9
問題点
試行錯誤したものの、うまくいかず、
上記に至りましたが、これでも、
・Event_1〜3のいずれかにNAが含まれる行は、NAと判定されてしまう
・欲しいのは「最も近い日付」であるのに、「最も小さい日差(絶対値)」しか求まっていない
・Event_1〜 3 ですが、実際のデータでは、Event_1〜 20までと多数あり、全部手打ちするのは現実的ではない
といった問題点があります。
ご教示いただけましたら幸いです。どうぞよろしくお願いいたします。
回答1件
あなたの回答
tips
プレビュー
バッドをするには、ログインかつ
こちらの条件を満たす必要があります。
2022/05/15 22:15