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  理由は、Browser Shotsはショートコード経由でimgタグを出力しますが、Auto Post Thumbnailはデータベースに保存されている投稿本文からimgタグを検索し、見つかった場合はアイキャッチを設定します。ショートコードは、ブラウザーに投稿本文が出力される直前にimgタグなどのHTMLタグに変換されるため、データベースに保存されているデータはショートコードのままです。つまり、Auto Post Thumbnailの処理が走る段階では、ショートコードのままなので、Auto Post Thumbnailの検索には引っ掛かりません。