回答編集履歴
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追記
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これは `/var/www/html/cakeATM/cake/app/Config/bootstrap.php` と `/var/www/html/cakeATM/cake/app/Config/stage` を `/var/www/html/cakeATM/cake/app/Config/production` にコピーするという意味です。なので `production` の中に `bootstrap.php` と `stage` ができます。
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> きぞんのbootstrap.phpを一気にコピーすることも可能でしょうか。
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リダイレクトがありなら `tee` で。
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tee app/Config/{stage,production}/bootstrap.php >/dev/null </var/www/html/cakeATM/cake/app/Config/bootstrap.php
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`xargs` をつかても良いなら `install` でディレクトリも一緒に作れます（がしかしこれを１コマンドと呼んで良いか・・）。
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xargs -n1 install -D /var/www/html/cakeATM/cake/app/Config/bootstrap.php <<<"app/Config/stage/bootstrap.php app/Config/production/bootstrap.php"
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これはシェルによって次のように展開されます。
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`/var/www/html/cakeATM/cake/app/Config/bootstrap.php` と `./app/Config/stage` を `./app/Config/production` にコピーするという意味です。
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ディレクトリを `-r` オプション無しでコピーしようとしているのでエラーになります。
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これはシェルによって次のように展開されます。
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これは `/var/www/html/cakeATM/cake/app/Config/bootstrap.php` と `/var/www/html/cakeATM/cake/app/Config/stage` を `/var/www/html/cakeATM/cake/app/Config/production` にコピーするという意味です。なので `production` の中に `bootstrap.php` と `stage` ができます。
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