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  ffmpeg本体はGPLまたはLGPLなのでwebサービスとして使用するには問題が出るケースは無いはずですが、

  使用するコーデックによっては色々と問題が出る可能性があります。

 

 

  まずは`ffmpeg ライセンス`あたりで検索して、発生し得る問題の概要を掴んでから調査、確認をされることをお勧めします。