回答編集履歴
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質問の回答を受けて その2を追記
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あと、mysql-config.ymlのhostnameをlocalhostではなく、127.0.0.1にしたらどうなるか（引き続きエラーになる場合はメッセージが変わらないかどうか）も教えてください。
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追記ありがとうございます。ログにもあまり大した情報が載ってないですね。。
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僕は手元でエラーを再現できる環境がないので、ちょっとこれ以上のコメントは難しそうです。どうもすいません。
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ちなみにTwitterでNewRelicの中の人から以下のようなコメントをもらっています。
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https://twitter.com/qryuu/status/1407873008467804160
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> New RelicサポートやNew Relic Expert Hub、
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On-host-Integrationの場合はそれぞれのGithubのIssueとしてお問い合わせ頂くようにご案内いただけますでしょうか。
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というわけで、公式のサポートを頼るのが一番の解決策かもしれません。もし解決したら自己回答をお願いします。
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kamiokanさんが参考にしている手順書がいまいちハッキリしないので、「このドキュメントの通りに進めようとしています」と、URLを明記してもらえるとこちらも回答しやすいかもしれません。（ https://docs.newrelic.com/docs/integrations/host-integrations/host-integrations-list/mysql-monitoring-integration/ でしょうか？）
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情報ありがとうございます。追加で質問なのですが、エラーメッセージに"Check the install log for more details: /root/.newrelic/newrelic-cli.log"とあります。このログの中身を記載してもらうことは可能でしょうか？（クレデンシャルな情報が載っていた場合は適宜隠しておいてください）
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あと、mysql-config.ymlのhostnameをlocalhostではなく、127.0.0.1にしたらどうなるか（引き続きエラーになる場合はメッセージが変わらないかどうか）も教えてください。
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