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パスに空白を含んでいるのが問題であるとしたら、gnuplotを`Program Files`下ではなく、空白を含まないパスにインストールして回避するしかないかもしれませんね。
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- ドライブレターをどう記述するか。Cygwinだと`/cygdrive/c/...`とかになるんですが、MSYS2だと`/c/...`なのかな？
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- ドライブレターをどう記述するか。Cygwinだと`/cygdrive/c/...`とかになるんですが、MSYS2だと`/c/...`なのかな？それとも`C:/...`でもいけるのか
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- ショートネームを使えるのか。つまり`PROGRA~1`でもいけるのか、`Program Files`を指定しないといけないのか
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- `Program Files`を指定しないといけない場合、このような空白を含むパスもいけるのかどうか。（いけるとしてもたぶん空白を`\`でエスケープしたりする必要がありそう）
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- `Program Files`を指定しないといけない場合、このような空白を含むパスもいけるのかどうか。（いけるとしてもたぶん空白を`\`でエスケープしたりする必要がありそう）
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エラーメッセージが「sh:」ってことは、ともかく/bin/sh相当のシェルが介在しているみたいですね。
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bashもインストールされていますよね？ターミナルでbashを起動して、bashからどうやって（どういうパスの記述で）gnuplot.exeを起動できるか試してみてください。で、起動できたら、そのパスをGNUPLOT_PATHに書けばよいことになります。
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- ショートネームを使えるのか。つまり`PROGRA~1`でもいけるのか、`Program Files`を指定しないといけないのか
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- `Program Files`を指定しないといけない場合、このような空白を含むパスもいけるのかどうか。（いけるとしてもたぶん空白を`\`でエスケープしたりする必要がありそう）。
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