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MultiIndexを使用する方法はどうでしょうか？
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3次元ではありませんがPandasのMultiIndexを使用する方法はどうでしょうか？
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```
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こちらでやりたい処理は出来ないでしょうか？
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【追記】
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MultiIndexを使用する方法はどうでしょうか？
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```python
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df_list = [Day1kiboutime, Day2kiboutime, Day3kiboutime]
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df_list2 = []
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i = 1
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for df in df_list:
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df = df.T
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df['kiboutime'] = 'Day' + str(i) + 'kiboutime'
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df = df.set_index('kiboutime', append=True)
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df = df.swaplevel(0, 1)
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df = df.T
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df_list2.append(df)
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i += 1
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multi_df = pd.concat(df_list2, axis=1)
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print(multi_df)
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#kiboutime Day1kiboutime Day2kiboutime Day3kiboutime
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#12時 13時 14時 15時 16時 17時 18時 19時 20時 12時 ... 20時 12時 13時 14時 15時 16時 17時 18時 19時 20時
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#member1 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 ... 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0
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#member2 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 ... 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0
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#member3 1 1 1 0 0 0 1 1 1 1 ... 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1
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#member4 1 1 1 0 0 0 1 1 1 1 ... 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1
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#member5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ... 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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12時のデータを抽出する例
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```python
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print(multi_df.xs('12時', level=1, axis=1))
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#kiboutime Day1kiboutime Day2kiboutime Day3kiboutime
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#member1 0 0 0
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#member2 0 0 0
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#member3 1 1 1
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#member4 1 1 1
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#member5 0 0 0
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``pandas``での話です。
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