回答編集履歴
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コメントでのご指摘を受けて修正。
answer
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@@ -2,4 +2,10 @@
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perl -pe 's/(?<!\r)\n//' < input.txt > output.txt
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追記: コメントでのご指摘を受けて修正。
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perl -pe 's/(?<!\r)\n/;/' < input.txt > output.txt
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