回答編集履歴
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追記
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時系列データに適応できるのか，相対比率を目的変数に用いられるのか，など不明点がありますが，時系列データが無理であれば特徴量ベースに変換してみます．ありがとうございました．
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追記：「scikit-learnにおいて2項目以上の出力値をfitさせる方法」というトピックが立っていました．
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https://teratail.com/questions/148354
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誤字修正
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@@ -1,4 +1,4 @@
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その後調べてみました．「複数の目的変数に対する回帰(multioutput regression)」が答えのようです．
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質問者ですがその後調べてみました．「複数の目的変数に対する回帰(multioutput regression)」が答えのようです．
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https://www.haya-programming.com/entry/2018/05/07/115144
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複数の目的変数に対応したモデルとして正準相関分析，ランダムフォレスト回帰，ニューラルネットワーク回帰などがあり，scikit-
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複数の目的変数に対応したモデルとして正準相関分析，ランダムフォレスト回帰，ニューラルネットワーク回帰などがあり，scikit-learnのパッケージがあるようです．
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