回答編集履歴
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コメントと質問集生を受けて追記
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for(int i = 0; i < a.size(); i++){
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map.put(a.get(i), b.get(i));
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}
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keyとなるIntegerに重複があるというのなら、そもそもMapを使うのが適当ではないということになります。
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intとList<String>をメンバに持つクラスを作ったほうがいいのではないでしょうか?
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補足
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2つのListを、順番を維持しながら対応関係を持たせるという意味でしょうか。
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だとすれば、Mapの実装型の一つ[LinkedHashMap](https://docs.oracle.com/javase/jp/8/docs/api/java/util/LinkedHashMap.html)が有効かと思われます。
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これは、データをputした順番に並べた状態でマッピングします。
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(ただし、通常のMap同様、keyが重複すると上書きされる。その場合、上書きされる前の順番は変わらない)
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通常のHashMapでは順番については保証されませんが、このクラスはentrySet()でエントリービューを取得した場合などにもこの挿入順が維持されます。
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```Java
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//このようなリストが先に存在しているとする
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List<Integer> a;
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