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として動かすとかですね。
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私は最近cygwin上でmakefileを使い始めました。
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(それまではWindowsコマンドプロンプト上でバッチファイルから...)
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なので詳しいことはわかりませんが、
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方法1: 上記で挙げた方法を「シェルスクリプトを介して」コンパイルする
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例えば、
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```ここに言語を入力
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make INCLUDE_PATHS=-I./src/dir
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```
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とシェルスクリプト( まあ、バッチファイルでもいいけど... ) に書いて、これを介してコンパイルする。
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方法2: 直接makefileに書き込む
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```ここに言語を入力
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/*project_dir*/
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CC = gcc
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# このへんにCFLAGSなり、独自のINCLUDEパスなりを追加する
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TARGET = http_object
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SRC_DIR = ./src/main
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INCLUDE_PATHS :=
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include ./src/Makefile
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$(TARGET):
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$(CC) $(INCLUDE_PATHS) $(SRC_DIR)/main.c $< -o $@
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```
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方法3: makefileを介して別のmakefileを呼び出す
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この方法はやったことありませんが、[参考資料](http://objectclub.jp/community/memorial/homepage3.nifty.com/masarl/article/gnu-make/rule.html)の「タスク」の項目みたいに、
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```ここに言語を入力
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# ファイル名 = comile.make
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compile:
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make CFLAGS=-I./src
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```
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としておいて、
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```ここに言語を入力
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make -f compile.make
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```
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とするとか。
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(うまくいくかどうかわかりませんが...)
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あと、インクルードに関しては INCLUDE( いや、CFLAGSの方か? )っていう、デフォルトで用意されている変数?があるようです。
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参考: [リンク1](http://urin.github.io/posts/2013/simple-makefile-for-clang)
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参考: [リンク2](https://stackoverflow.com/questions/341387/adding-a-directory-for-the-headers-in-a-makefile)
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