回答編集履歴
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print(dt) # 2019-09-04 09:32:45.599578
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6桁であれば、[ISO 8601](https://ja.wikipedia.org/wiki/ISO_8601) フォーマットなので、Python 3.7 以降であれば、以下の関数を使っても datetime 型に変換できます。
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dt = datetime.fromisoformat(s[:-1])
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## 参考文献
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* [python - How to convert a timestamp string with 7 digits on the microseconds part using strptime? - Stack Overflow](https://stackoverflow.com/questions/50500512/how-to-convert-a-timestamp-string-with-7-digits-on-the-microseconds-part-using-s)
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