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1 tiitoiさんからの回答を反映させた上での回答としました

nomnommorn

nomnommorn score 0

2019/06/14 09:02  投稿

上記のtiitoiさんからの助言を受け、Tensorflowの再インストールなどを行なったあと、  
以下の質問投稿を見つけ、gakushu_dataフォルダの中身を見直し整理して解決しました!
[https://github.com/tensorflow/tensorflow/issues/2072](https://github.com/tensorflow/tensorflow/issues/2072)
無事retrain.pyが実行され、retrained_graph.pbとretrained_labels.pbが生成されました。
見直し内容は主に以下です。
- 拡張子が画像データ以外のものがある(拡張子がついていないなど)
- サイズがすぎる
- 画像データの名前が長い(File name too long)

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