回答編集履歴
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追記を受けて
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CHANGED
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@@ -1,2 +1,13 @@
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こちらの環境では自作exe + log4net + Newton.Json + AMLで問題なくマージできました
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自作ライブラリ含め全てのdllのターゲットの.NETバージョンが一致している事を一度確認してみてください。
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自作ライブラリ含め全てのdllのターゲットの.NETバージョンが一致している事を一度確認してみてください。
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# 補足を受けて
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軽く調べたところILMergeのバグの可能性が高いです
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[https://github.com/Microsoft/CodeContracts/issues/53](https://github.com/Microsoft/CodeContracts/issues/53)
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オープンソース版ILMergeであるILRepackを使用したところ正常なバイナリが吐かれたので
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一度こちらを使ってみてはいかがでしょうか
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引数は全く変えずにできると思います
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[https://github.com/gluck/il-repack](https://github.com/gluck/il-repack)
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(またはDirectLinkから .nupkg -> .zip に変更 [http://nuget.org/api/v2/package/ILRepack](http://nuget.org/api/v2/package/ILRepack))
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