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[include](http://jinja.pocoo.org/docs/2.10/templates/#include)文自体には問題はないように見えます。
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#### 検証
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以下コードにて、当方環境では構文エラー発生せず動作しました。
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提示コードでは`jinja2.exceptions.UndefinedError: 'dataset_count' is undefined`発生したため定義しています。
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また、`index.html`では`{% include 'common/resource_info.html' %}`はコメントアウトしています。
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`index_partial/datasets.html`は提示コードのままです。
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```Python
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from flask import Flask, render_template
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app = Flask(__name__)
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def get_system_info():
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return
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@app.route('/')
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def index():
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return render_template("index.html", system_info=get_system_info(), dataset_count=0)
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if __name__ == '__main__':
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app.run(debug=True)
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<!-- index.html -->
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{% block page_content %}
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<div class="container" id="main">
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<div class="row">
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<div class="col-md-9">
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{% include 'index_partial/datasets.html' %}
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</div>
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<div class="col-md-3">
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{# {% include 'common/resource_info.html' %} #}
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</div>
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</div>
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</div>
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{% endblock %}
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`endfor`や`if`、`endif`の前後は`{{%`ではなく`{%`では？
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参考：[jinja2入門 その1](https://www.python.ambitious-engineer.com/archives/760)
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[include](http://jinja.pocoo.org/docs/2.10/templates/#include)文自体には問題はないように見えます。
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