回答編集履歴
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なお、ご質問には**事実の記載が少ない**と感じました。なんでもかんでもたくさん情報があればよいわけではありませんが、閲覧者には質問者さんがどんな環境で何をどうやったのか正確にわからないのですから、例えばmatplotlibのバージョンが古い可能性があるかも知れないと思ったなら実際のバージョンを明記しておくべきだと思います。「どの事実を明記すべきか」についてもう少し配慮でき
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なお、ご質問には**事実の記載が少ない**と感じました。なんでもかんでもたくさん情報があればよいわけではありませんが、閲覧者には質問者さんがどんな環境で何をどうやったのか正確にわからないのですから、例えばmatplotlibのバージョンが古い可能性があるかも知れないと思ったなら実際のバージョンを明記しておくべきだと思います。「どの事実を明記すべきか」についてもう少し配慮できたら・・・といったところではないでしょうか。以下の自分の記述は逆に冗長すぎると思いますが何かのヒントになればと思いあえてそうしています。
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自分の環境では質問者さんのコードとほぼ同じもの(h5py, numpy, matplotlibを使ったもの)が動作したので参考までに自分の環境についてコメントしてみます。
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自分の環境(Windows 10 + Anaconda 2.7)では質問者さんのコードとほぼ同じもの(h5py, numpy, matplotlibを使ったもの)が動作したので参考までに自分の環境についてコメントしてみます。
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