回答編集履歴
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追記
test
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TCP/IPじゃなく名前付きパイプで接続するのであればpyodbcの方が良いと思います。私も昔pymssqlで頑張ってみましたが、名前付きパイプでの接続はどうしても出来なくて諦めたことがあります。
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それでもpymssqlで突き進むならデバッグログオプションを有効にして原因を探ることになると思います。
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http://www.freetds.org/userguide/logging.htm
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