回答編集履歴
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追記
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@@ -17,4 +17,52 @@
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トップレベルウィンドウがいらないのにTk()で生成しているコードをみて「なんだかへんだなぁ」と感じていたのです。
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外してたらスミマセン
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外してたらスミマセン
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追記：スミマセンやはり外してたようです。
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よくよくやってみるとTcl()としてもダイアログ/メッセージボックスなどの機能を使うとTkのトップウィンドウが出てくるみたいですね。Tcl/Tkで`wm withdraw`(Tkinterでいうところの`root.withdraw()`はトップウィンドウを見せたくないときの普通のマナーなのかも知れません。
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ダイアログを閉じたとき、トップウィンドウが消えてくれたり消えてくれなかったりするのはtclインタープリタの(内部の?)メインループがまだ動き続けているということではないかと思います。
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当方Windows10でAnacondaではない所謂普通の(?)Python 3.6.0なので質問者さんの環境での確認はできてないのですが次のようにしたらどうなるでしょう？
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リスト2: withdrawがだめならdestroyしてみたらどうか？
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```python
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import tkinter
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import tkinter.filedialog
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def fd():
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root = tkinter.Tk()
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root.withdraw()
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foldername = tkinter.filedialog.askdirectory()
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root.destroy()
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return foldername
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print(fd())
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```
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リスト3: tclインタープリタをアプリ終了時に停止する構造にしてみたらどうか
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```python
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import tkinter
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import tkinter.filedialog
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def fd():
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# Tkinterのトップウィンドウの処理はメインに委ね
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# こうした関数ではそれを意識しない
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foldername = tkinter.filedialog.askdirectory()
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return foldername
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def main():
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# アプリのメイン処理
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# この中からfd()なども呼ぶ
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foldername = fd()
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...
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if __name__ == '__main__':
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root = tkinter.Tk()
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root.withdraw()
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main()
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root.quit()
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```
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追記
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return foldername
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トップレベルウィンドウが必要ない処理を想定しているなら上記のようにTk()のかわりにTcl()を用いたらどうなるでしょうか。Windows10だとこちらでも動きました。
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トップレベルウィンドウが必要ない処理を想定しているなら上記のようにTk()のかわりにTcl()を用いたらどうなるでしょうか。Windows10(Python 3.6.0)だとこちらでも動きました。
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トップレベルウィンドウを使わない場合withdraw()とやっているサンプルをよく見る気がしますが、そうせずにTcl()とする方がもしや素直な書き方なのではないかと思いました。
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