回答編集履歴
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テキスト形式のメリット
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まず最初に、バイナリデータを扱いたいのなら、`printf`や`scanf`ではなく（これらはテキストの入出力用です）、`fwrite`や`fread`を使うものです。
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そして、「別のプログラムで使う」ような可搬性のあるデータであれば、（バイナリでどういう形式になっているのか決まっているものや、テキストにすると冗長になりすぎるマルチメディア系のデータなどは除いて）テキストのままやり取りするほうが便利です。最近は、Microsoft Officeのファイル形式すら、XMLをzipで固めたものになっています。
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そして、「別のプログラムで使う」ような可搬性のあるデータであれば、（バイナリでどういう形式になっているのか決まっているものや、テキストにすると冗長になりすぎるマルチメディア系のデータなどは除いて）テキストのままやり取りするほうが便利です。最近は、Microsoft Officeのファイル形式すら、XMLをzipで固めたものになっています。
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バイナリデータを扱うとなれば、環境の違いでビット数やエンディアンなどの違いが出るので、そこまで含めて慎重に作る必要があります。テキストであれば、その差は気にしなくても良くなります。
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