回答編集履歴

- 左右のラベル同士及びテキストボックス同士は同じサイズ（高さ）ですよね？

- 気をつけないといけないのは、コントロール複数選択する際、最後に選択したコントロールを基準に整列が行われるということです。（選択枠の上下左右の四角の点が黒色のものが基準になる）

- この場合、上から順に選択したと思うのですが、そうすると一番下のtextboxが基準になります。もし、左右の一番下のtextbox同士が同じ高さにあるのならズレは発生しないと思うのですが、もしそこでずれていると左右でずれてしまうことになると思います。

- 整列の基準をどれにするのかを決め、それがずれないようにしておけばうまく整列できると思います。