回答編集履歴
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--enable-sharedの確認方法追加
test
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[VimでPython2とPython3を同時に使うためには、両方のバイナリが--enable-sharedオプション付きでビルドされている必要があります。](http://h-miyako.hatenablog.com/entry/2014/11/11/070536)ということのようで、pythonを自分で、buildする必要がありそうです。
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`--enable-shared`になっているかは、`python -c 'import distutils.sysconfig; print(distutils.sysconfig.get_config_var("CONFIG_ARGS"))'`で確認ができそうです。
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