回答編集履歴
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answer
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現在挙げているソースコードを実行してみました
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現在挙げているソースコードを実行してみました。
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私の環境では
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``plt.draw()`` の部分を ``plt.show()`` に修正することで問題なくネットワークが描写されております。(Warningは出力されておりません)
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Warningが出る問題ですが、もしかしたら[こちら](https://github.com/matplotlib/matplotlib/issues/5209) に記述なある不具合なのではないでしょうか。
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mataplotlibを最新版にアップグレードしてみてはいかがでしょうか。
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