質問編集履歴
4
進捗を書きました。
title
CHANGED
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File without changes
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body
CHANGED
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@@ -75,6 +75,9 @@
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75
75
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ここの15of20を読むと、
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76
76
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FTPで、CRANのFTPにtar.gzファイルをアップし、CRANにメールをしろとあるのですが、
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77
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アップした段階で使用はできるんでしょうか？できないのでしょうか？
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+
また、アップの仕方が分かりません。記載のftp～にアクセスしましたが、
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+
これをftpで開けません、FTPで開く、を押しても何も起きません。
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+
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CRANの許可がいるとなったら、審査は厳しそうですよね・・・？
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次に、コマンドで使えるようになったらパッケージを自作したいのですが、どのようにしていけば良いのでしょうか・・・？
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```
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3
進捗を記しました。
title
CHANGED
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@@ -1,1 +1,1 @@
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1
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-
Rのパッケージ作
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1
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+
Rのパッケージを自作したい
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body
CHANGED
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@@ -1,10 +1,8 @@
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1
1
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Rのパッケージ作成を行っております、
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2
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-
サイトを参考にして
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2
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+
以下のサイトを参考に、まず完全に模倣して、できるかどうかやってみたのですが、
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3
3
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https://sites.google.com/site/scriptofbioinformatics/r-tong-ji-guan-xi/rnopakkeji-kai-fanitsuite-r
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-
エラーが出てしまいました、またそのエラーの理由が分からず、どこを直せば良いのか分かりません、
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進捗した所まで、具体的に書きました、やってみた事等ももちろん記載しているので、アドバイスお願いします。
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+
```やってみた事
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Rstudioに入力したコード
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setwd("C:/Users/USER/Desktop")
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10
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@@ -53,10 +51,6 @@
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'AAAA/data/A.rda'
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* building 'AAAA_1.0.tar.gz'
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-
buildingとありますが、こんなファイルは作成されていません、
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-
なんか、3.50じゃないから古すぎるとか・・・？
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-
何をどう変えればいいんでしょう、一応最新のRstudioをDLしていると思うのですが・・・。
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-
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RStudioについて
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Version 1.4 1717
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2009-2021 RStudio, PBC
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@@ -65,5 +59,22 @@
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C:\Program Files\R\R-4.1.1\bin
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66
60
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のx64を、PATHに追加しているので、これが使用されていると思います。
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61
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-
なんか、一応AAAA.tar.gzがデスクトップ上にできて
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+
なんか、一応AAAA.tar.gzがデスクトップ上にできており、
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+
R CMD INSTALL AAAA
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64
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+
して、
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+
library("AAAA")
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+
data(A)
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+
A
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+
printA(A)
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+
すると、hogeと表示されたのですが、これでいいんでしょうか・・・？
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+
```
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71
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+
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72
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+
```やりたい事＆聞きたい事
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+
これをRのコマンドでインストールして使えるようにしたい場合、
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+
https://www.slideshare.net/yokkuns/10r
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75
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+
ここの15of20を読むと、
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+
FTPで、CRANのFTPにtar.gzファイルをアップし、CRANにメールをしろとあるのですが、
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+
アップした段階で使用はできるんでしょうか？できないのでしょうか？
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+
CRANの許可がいるとなったら、審査は厳しそうですよね・・・？
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+
次に、コマンドで使えるようになったらパッケージを自作したいのですが、どのようにしていけば良いのでしょうか・・・？
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+
```
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2
追記しましたー。
title
CHANGED
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File without changes
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body
CHANGED
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@@ -63,4 +63,7 @@
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63
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64
64
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Rについて
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65
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C:\Program Files\R\R-4.1.1\bin
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-
のx64を、PATHに追加しているので、これが使用されていると思います。
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66
|
+
のx64を、PATHに追加しているので、これが使用されていると思います。
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67
|
+
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|
+
なんか、一応AAAA.tar.gzがデスクトップ上にできていたのですが、
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69
|
+
これでいいんでしょうか？エラーはなかった？
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1
進捗したところまで、具体的に書きました。
title
CHANGED
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File without changes
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body
CHANGED
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@@ -2,79 +2,65 @@
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2
2
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サイトを参考にして行ったのですが、
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3
3
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https://sites.google.com/site/scriptofbioinformatics/r-tong-ji-guan-xi/rnopakkeji-kai-fanitsuite-r
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4
4
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エラーが出てしまいました、またそのエラーの理由が分からず、どこを直せば良いのか分かりません、
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-
フォルダは、デスクトップ内にtestというフォルダを作り、その中にAAAAフォルダを作りました。
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6
|
-
し
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5
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+
進捗した所まで、具体的に書きました、やってみた事等ももちろん記載しているので、アドバイスお願いします。
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7
6
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8
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-
以下がコマンドプロンプトに表示されたエラーです。
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-
C:\Users\user\Desktop\test>R CMD check AAAA
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10
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-
* using log directory 'C:/Users/user/Desktop/test/AAAA.Rcheck'
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11
|
-
* using R version 4.1.0 (2021-05-18)
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12
|
-
* using platform: x86_64-w64-mingw32 (64-bit)
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13
|
-
* using session charset: CP932
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14
|
-
* checking for file 'AAAA/DESCRIPTION' ... OK
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15
|
-
* checking extension type ... Package
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16
|
-
* this is package 'AAAA' version '1.0'
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17
|
-
* checking package namespace information ... OK
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18
|
-
* checking package dependencies ... OK
|
|
19
|
-
* checking if this is a source package ... OK
|
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20
|
-
* checking if there is a namespace ... OK
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21
|
-
* checking for .dll and .exe files ... OK
|
|
22
|
-
* checking for hidden files and directories ... OK
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|
23
|
-
* checking for portable file names ... OK
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24
|
-
* checking whether package 'AAAA' can be installed ... ERROR
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25
|
-
Installation failed.
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26
|
-
See 'C:/Users/user/Desktop/test/AAAA.Rcheck/00install.out' for details.
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27
|
-
* DONE
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28
7
|
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29
|
-
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8
|
+
Rstudioに入力したコード
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30
|
-
See
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31
|
-
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9
|
+
setwd("C:/Users/USER/Desktop")
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32
|
-
for details.
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33
10
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|
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34
|
-
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11
|
+
package.skeleton(list=c("A","printA"),name="AAAA")
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35
12
|
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13
|
+
出力されたコード
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36
|
-
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14
|
+
Creating directories ...
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15
|
+
Creating DESCRIPTION ...
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16
|
+
Creating NAMESPACE ...
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37
|
-
|
|
17
|
+
Creating Read-and-delete-me ...
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38
|
-
* using platform: x86_64-w64-mingw32 (64-bit)
|
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39
|
-
|
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18
|
+
Saving functions and data ...
|
|
19
|
+
Making help files ...
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20
|
+
Done.
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21
|
+
Further steps are described in './AAAA/Read-and-delete-me'.
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22
|
+
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23
|
+
作成されたディレクトリ、フォルダ
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24
|
+
デスクトップ-AAAA-data,man,R,DESCRIPTION,NAMESPACE,Rea-and-delete-me
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25
|
+
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26
|
+
DESCRIPTIONの内容を、青字のものに変更。
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27
|
+
|
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28
|
+
NAMESPACEを、exportPattern("^[[:alpha:]]+")に変更。
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29
|
+
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|
30
|
+
Read-and-delete-meを削除。
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31
|
+
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|
32
|
+
AAAA-package.Rdの内容を、青字のものに変更。
|
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33
|
+
|
|
34
|
+
A.Rdの内容を、青字のものに変更。
|
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35
|
+
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36
|
+
printA.Rdの内容を、青字のものに変更。
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|
37
|
+
|
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38
|
+
コマンドプロンプトに入力したコード
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39
|
+
cd C:\Users\USER\Desktop
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40
|
+
R CMD build AAAA
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41
|
+
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42
|
+
出力されたエラー
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40
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* checking for file 'AAAA/DESCRIPTION' ... OK
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41
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-
* checking extension type ... Package
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42
|
-
*
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44
|
+
* preparing 'AAAA':
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43
|
-
* checking
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45
|
+
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
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44
|
-
* checking package dependencies ... OK
|
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45
|
-
* checking if this is a source package ... OK
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46
|
-
* checking if there is a namespace ... OK
|
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47
|
-
* checking for
|
|
46
|
+
* checking for LF line-endings in source and make files and shell scripts
|
|
48
|
-
* checking for
|
|
47
|
+
* checking for empty or unneeded directories
|
|
49
|
-
* checking for portable file names ... OK
|
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50
|
-
*
|
|
48
|
+
* looking to see if a 'data/datalist' file should be added
|
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49
|
+
NB: this package now depends on R (>= 3.5.0)
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|
50
|
+
WARNING: Added dependency on R >= 3.5.0 because serialized objects in
|
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51
|
+
serialize/load version 3 cannot be read in older versions of R.
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51
|
-
|
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52
|
+
File(s) containing such objects:
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52
|
-
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53
|
+
'AAAA/data/A.rda'
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|
53
|
-
* DONE
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|
-
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54
|
+
* building 'AAAA_1.0.tar.gz'
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55
55
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|
+
buildingとありますが、こんなファイルは作成されていません、
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57
|
+
なんか、3.50じゃないから古すぎるとか・・・？
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56
|
-
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58
|
+
何をどう変えればいいんでしょう、一応最新のRstudioをDLしていると思うのですが・・・。
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57
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58
|
-
* installing *source* package 'AAAA' ...
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59
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-
** using staged installation
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60
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-
** R
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61
|
-
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60
|
+
RStudioについて
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|
-
** byte-compile and prepare package for lazy loading
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|
-
** help
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64
|
-
*** installing help indices
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|
-
** building package indices
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66
|
-
** testing if installed package can be loaded from temporary location
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67
|
-
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61
|
+
Version 1.4 1717
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68
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-
Error: package or namespace load failed for 'AAAA' in namespaceExport(ns, exports):
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-
未定義のエクスポートです: A
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|
-
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|
+
2009-2021 RStudio, PBC
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71
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-
実行が停止されました
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|
-
*** arch - x64
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|
-
Error: package or namespace load failed for 'AAAA' in namespaceExport(ns, exports):
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|
-
未定義のエクスポートです: A
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75
|
-
エラー: loading failed
|
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76
|
-
実行が停止されました
|
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77
|
-
ERROR: loading failed for 'i386', 'x64'
|
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|
-
* removing 'C:/Users/user/Desktop/test/AAAA.Rcheck/AAAA'
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79
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|
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64
|
+
Rについて
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65
|
+
C:\Program Files\R\R-4.1.1\bin
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-
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66
|
+
のx64を、PATHに追加しているので、これが使用されていると思います。
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