Juliaのpathが通らず保存もされない

Question

実現したいこと

プロンプトを起動するたびに
ENV["PYTHON"]=""
ENV["JULIA_SSL_CA_ROOTS_PATH"]=""
を入力したくない

前提

julia1.67をインストールし、add PyPlotするのに上記環境変数を求められたので入力しました。
そのときはパスが通るのですが、プロンプトを閉じるとまた必要になっています。
ユーザーもシステムも両方に
PYTHON="アナコンダのパイソンのパス"
JULIA_SSL_CA_ROOTS_PATH="cacert.pemのパス"
を入れていてJULIA_SSL_CA_ROOTS_PATHはENVにも反映されていますが、例えばadd PyPlotでエラーが出ます。
ENV["JULIA_SSL_CA_ROOTS_PATH"]="cacert.pemのパス"
でもエラーなのでためしにPYTHON=" "で登録しましたが、だめでした。
環境変数に空文字列は登録できなさそうでした。
またENVに表示されていないだけかと思いusing PyPlotも試しましたが通っていませんでした。
こちらはENV["PYTHON"]=""でもENV["PYTHON"]="アナコンダのパイソンのパス"でもできました。
また、Pkg.build("PyCall")を試しましたがやはり保存はされませんでした。

発生している問題・エラーメッセージ

ERROR: GitError(Code:ERROR, Class:SSL, Your Julia is built with a SSL/TLS engine
 that libgit2 doesn't know how to configure to use a file or directory of certif
icate authority roots, but your environment specifies one via the SSL_CERT_FILE
variable. If you believe your system's root certificates are safe to use, you ca
n `export JULIA_SSL_CA_ROOTS_PATH=""` in your environment to use those instead.)

以上以外はインストールしてからしていません。
初期設定はjuliaのインストールでパスにチェックしたくらいです。
また、最新版はうまく動かなかったのでアンインストールし.juliaを削除しました。
初期設定を忘れているのでしょうか。

よろしくお願いします。

Answer 1

バージョンは1.67ではなくて，1.6.7でしょうか。

正直OSのバージョンが分からないので，手探りで回答するので
的を外しているかもしれませんが，
基本的に私は追加質問を受け付けないので，
何か追加の情報を書かれても答えないのでよろしくお願いします。
(休みの日は家の家事が優先です)

原因は私にはよく分かりませんが，
過去に存在したJuliaProとか入れたことがあるのであれば，
Julia関連の環境変数がもれなく破壊されているので注意が必要と思います。
OS上のJULIA_で始まる環境変数が設定されまくりです。通常はこれらが自動で設定されることはありません。
唯一JULIA_EDITORはデフォルトのテキストエディタなので，
各自設定することがありますが，これはあまり関係ないでしょう。

さて，Julia言語が自動的に環境変数を保存することはないと思います。

クリーンな状態からなら，次のようなスクリプトで構築可能でしょうか?(julia内のcondaを使うこと前提)

# pyplot-setup.jl

ENV["JULIA_SSL_CA_ROOTS_PATH"]=""
using Pkg

Pkg.update()

# もし，CONDA_JL_HOMEの環境変数が変更されていれば，
# ENV["CONDA_JL_HOME"]="" をする必要あり
# もし，CONDA_JL_CONDA_EXEの環境変数が変更されていれば，
# ENV["CONDA_JL_CONDA_EXE"]="" をする必要あり

Pkg.add("Conda")
import Conda

# Julia標準のminicondaの設定
Conda.update()
# matplotlib追加
Conda.add("matplotlib")
# numpy等事前にインストールしたいモジュールがあればここに追加

# PyCall 設定
Pkg.add("PyCall")
ENV["PYTHON"]=""
Pkg.build("PyCall")

Pkg.add("PyPlot")

この前に必要な手順は大体次のような感じでしょうか?

1. パッケージモードからPyPlot，PyCall，Condaの順にパッケージを削除
2. もし，IJuliaもインストール済みならCondaの前に削除
3. .juliaフォルダの直下にあるcondaフォルダ以下を全削除
4. セットアップスクリプトを実行(julia pyplot-setup.jlかjuliaを起動してからinclude("pyplot-setup.jl"))

以上のような感じでセットアップができると思います。

後，毎回環境変数を変更したくないというのであれば，
~/.julia/の下にconfigフォルダを作成し，その下にstartup.jlを作って
(最終的には~/.julia/config/startup.jlのファイル)

ENV["PYTHON"]=""
ENV["JULIA_SSL_CA_ROOTS_PATH"]=""

と書くぐらいかと思います。

追記

for senv in ["PYTHON", "JULIA_SSL_CA_ROOTS_PATH"]
    if senv in keys(ENV)
        delete!(ENV, senv)
    end
end

の方がスマートでしょうか？

なお，エラーメッセージの方はlibgit2のエラーで，おそらくパッケージをダウンロード
する時にSSLの認証でエラーになっているようです。
ですので，パッケージもうまくダウンロードできていないかもしれません。

後，OSが書いていませんが，新しいバージョンのJuliaがうまく動かないとのことなので，
Cのライブラリが古いLinuxではないかと思います。

PyCallのbulid前にJuliaのCondaパッケージのPythonを使うのにENV["PYTHON"]=""
が必要なのはPyCallをビルドする直前だけなので，
一回ビルドした後は何の値になっててもおそらくは大丈夫かと思います。

ただし，パッケージモードで全体のパージョンアップをしようとupdateをすると，
不意にリビルドが走る時があるので，
この時にはENV["PYTHON"]=""してリビルドする必要があるかもしれません。

Comments

[keraker]

ありがとうございます。
無事ENVを設定し、またパッケージも使用可能になりました。
丁寧なご回答改めてありがとうございます。