ローカルのhtmlからWEBシステムへwindow.openで遷移させた後、window.closeで自動で閉じるシステムを使用しています。
htmlのソースは以下になります。立ち上げた空ウィンドウにsubmitしてから2秒後にウィンドウを閉じる仕様です。
var web_window = window.open("","window_name","location=yes");
document.FORM.target = "window_name";
FORM.submit();
setTimout(function(){web_window.window.close();},2000);
submitしているFORMで遷移するサイトURLは、ポリシーによってIEモードで開くよう設定されたURLです。
そのため、html(Edge)からWEBシステム(IEモード)へと遷移するのですが、開いたWEBシステムのウィンドウをwindow.close()で閉じることができません。html(Edge)からWEBシステム(Edge)を開く場合は、開かれたWEBシステム(Edge)のウィンドウを閉じることはできています。
何か対処法があればご教示いただきたいです。

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