PHPEXCELで出力したExcel(xlsx)ファイルを開いた際にエラーが発生します・・・

###前提・実現したいこと
PHPEXCELを使用してxlsx(2007以降形式)のファイルを出力したいと考えております。

###発生している問題・エラーメッセージ

PHPEXCELを使用してxlsxファイルを作成後、作成されたファイルを開くと
「一部の内容に問題が見つかりました。可能な限りの内容を・・・・」
と出て、「はい」をおすと、「削除されたレコード：/xl/workbook.xml テーマ(ブック)」と表示され、データは表示されるのですが、警告・エラーがでてしまい困っています。

terateilにのっている過去記事等も見させていただきましたが、

//PHPExcelファイルの読み込み
include_once ( DIR . '/Classes/PHPExcel.php');
include_once ( DIR . '/Classes/PHPExcel/IOFactory.php');

// Excel2007形式(xlsx)テンプレートの読み込み
$reader = PHPExcel_IOFactory::createReader('Excel2007');
$excel = $reader->load( DIR . '/template.xlsx' );

// シートの設定
$excel->setActiveSheetIndex(0);//何番目のシートか
$sheet = $excel->getActiveSheet();//有効になっているシートを代入

// セルに値を入力
$sheet->setCellValue('A8', 'こんにちは！');//A1のセルにこんにちは！という値を入力

// Excel2007形式で出力する
$writer = PHPExcel_IOFactory::createWriter($excel, 'Excel2007');

$file_name = 'output.xlsx';//ダウンロードさせるファイル名
header('Content-Type: application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet');//ダウンロードの指示
header("Content-Disposition: attachment; filename=$file_name");//ダウンロードするファイル名
$writer->save('php://output');
exit; // これ入れてください

上記ソースコードで問題なく動くという意見がみられました。

実際に上記ソースコードを試しましたが、問題は解決しませんでした。

セルに埋め込む値をEUCからUTF8に度々変換して出力しておりますが、文字コード等関係はあるのでしょうか。

###該当のソースコード

業務の性質上ソースコードを載せることができません(小規模な会社ですが、情報の持ち出しはNGとされているため）

###試したこと
文頭でも述べましたが、terateilの過去記事や、excel特有のエラーを調べたり、phpexcelの仕様も確認したりしました。
しかし、なかなか目的とする回答がみつけられなかった次第です。

###補足情報(言語/FW/ツール等のバージョンなど)
開発言語:PHP
PHPEXCELバージョン:1.8.0
出力excel形式：xlsx
実際にexcelを開くofficeのバージョン：2013

長くなりましたが、こちらの現象にこころあたりのあるかたがいらっしゃいましたら、ご回答いただけると非常に助かります。

よろしくお願いします。