Ruby on railsでbundle installできまません

Question

与えられたGemfileからbundle installをしたところ以下のエラーメッセージ1が発生しました。
エラーメッセージ1からgem install sqlite3 -v '1.3.8'するよう書いてあるためgem install sqlite3 -v '1.3.8'を行ったところエラーメッセージ2になりました。
知識不足で申し訳ないのですが、解決策をお教えいただければ幸いです。

###発生している問題・エラーメッセージ1

Gem::Ext::BuildError: ERROR: Failed to build gem native extension.

current directory:
/Users/Takahiro/.rbenv/versions/2.3.1/lib/ruby/gems/2.3.0/gems/sqlite3-1.3.8/ext/sqlite3
/Users/Takahiro/.rbenv/versions/2.3.1/bin/ruby -r ./siteconf20161127-37682-3mbd8o.rb extconf.rb
checking for sqlite3.h... yes
checking for sqlite3_libversion_number() in -lsqlite3... yes
checking for rb_proc_arity()... yes
checking for sqlite3_initialize()... yes
checking for sqlite3_backup_init()... yes
checking for sqlite3_column_database_name()... no
checking for sqlite3_enable_load_extension()... no
checking for sqlite3_load_extension()... no
checking for sqlite3_open_v2()... yes
checking for sqlite3_prepare_v2()... yes
checking for sqlite3_int64 in sqlite3.h... yes
checking for sqlite3_uint64 in sqlite3.h... yes
creating Makefile

To see why this extension failed to compile, please check the mkmf.log which can be found here:

/Users/Takahiro/.rbenv/versions/2.3.1/lib/ruby/gems/2.3.0/extensions/x86_64-darwin-15/2.3.0-static/sqlite3-1.3.8/mkmf.log

current directory:
/Users/Takahiro/.rbenv/versions/2.3.1/lib/ruby/gems/2.3.0/gems/sqlite3-1.3.8/ext/sqlite3
make "DESTDIR=" clean

current directory:
/Users/Takahiro/.rbenv/versions/2.3.1/lib/ruby/gems/2.3.0/gems/sqlite3-1.3.8/ext/sqlite3
make "DESTDIR="
compiling backup.c
compiling database.c
compiling exception.c
compiling sqlite3.c
compiling statement.c
statement.c:261:11: warning: implicit declaration of function 'RBIGNUM' is invalid in C99
[-Wimplicit-function-declaration]
      if (RBIGNUM_LEN(value) * SIZEOF_BDIGITS <= 8) {
          ^
./sqlite3_ruby.h:16:24: note: expanded from macro 'RBIGNUM_LEN'
#define RBIGNUM_LEN(x) RBIGNUM(x)->len
                       ^
statement.c:261:11: error: member reference type 'int' is not a pointer
      if (RBIGNUM_LEN(value) * SIZEOF_BDIGITS <= 8) {
          ^~~~~~~~~~~~~~~~~~
./sqlite3_ruby.h:16:36: note: expanded from macro 'RBIGNUM_LEN'
#define RBIGNUM_LEN(x) RBIGNUM(x)->len
                       ~~~~~~~~~~  ^
statement.c:261:32: error: use of undeclared identifier 'SIZEOF_BDIGITS'
      if (RBIGNUM_LEN(value) * SIZEOF_BDIGITS <= 8) {
                               ^
1 warning and 2 errors generated.
make: *** [statement.o] Error 1

make failed, exit code 2

Gem files will remain installed in
/Users/Takahiro/.rbenv/versions/2.3.1/lib/ruby/gems/2.3.0/gems/sqlite3-1.3.8 for inspection.
Results logged to
/Users/Takahiro/.rbenv/versions/2.3.1/lib/ruby/gems/2.3.0/extensions/x86_64-darwin-15/2.3.0-static/sqlite3-1.3.8/gem_make.out

An error occurred while installing sqlite3 (1.3.8), and Bundler cannot continue.
Make sure that `gem install sqlite3 -v '1.3.8'` succeeds before bundling.

###発生している問題・エラーメッセージ2

Building native extensions.  This could take a while...
ERROR:  Error installing sqlite3:
ERROR: Failed to build gem native extension.

    current directory: /Users/Takahiro/.rbenv/versions/2.3.1/lib/ruby/gems/2.3.0/gems/sqlite3-1.3.8/ext/sqlite3
/Users/Takahiro/.rbenv/versions/2.3.1/bin/ruby -r ./siteconf20161127-41731-1pc2nfg.rb extconf.rb
checking for sqlite3.h... yes
checking for sqlite3_libversion_number() in -lsqlite3... yes
checking for rb_proc_arity()... yes
checking for sqlite3_initialize()... yes
checking for sqlite3_backup_init()... yes
checking for sqlite3_column_database_name()... no
checking for sqlite3_enable_load_extension()... no
checking for sqlite3_load_extension()... no
checking for sqlite3_open_v2()... yes
checking for sqlite3_prepare_v2()... yes
checking for sqlite3_int64 in sqlite3.h... yes
checking for sqlite3_uint64 in sqlite3.h... yes
creating Makefile

To see why this extension failed to compile, please check the mkmf.log which can be found here:

  /Users/Takahiro/.rbenv/versions/2.3.1/lib/ruby/gems/2.3.0/extensions/x86_64-darwin-15/2.3.0-static/sqlite3-1.3.8/mkmf.log

current directory: /Users/Takahiro/.rbenv/versions/2.3.1/lib/ruby/gems/2.3.0/gems/sqlite3-1.3.8/ext/sqlite3
make "DESTDIR=" clean

current directory: /Users/Takahiro/.rbenv/versions/2.3.1/lib/ruby/gems/2.3.0/gems/sqlite3-1.3.8/ext/sqlite3
make "DESTDIR="
compiling backup.c
compiling database.c
compiling exception.c
compiling sqlite3.c
compiling statement.c
statement.c:261:11: warning: implicit declaration of function 'RBIGNUM' is invalid in C99 [-Wimplicit-function-declaration]
      if (RBIGNUM_LEN(value) * SIZEOF_BDIGITS <= 8) {
          ^
./sqlite3_ruby.h:16:24: note: expanded from macro 'RBIGNUM_LEN'
#define RBIGNUM_LEN(x) RBIGNUM(x)->len
                       ^
statement.c:261:11: error: member reference type 'int' is not a pointer
      if (RBIGNUM_LEN(value) * SIZEOF_BDIGITS <= 8) {
          ^~~~~~~~~~~~~~~~~~
./sqlite3_ruby.h:16:36: note: expanded from macro 'RBIGNUM_LEN'
#define RBIGNUM_LEN(x) RBIGNUM(x)->len
                       ~~~~~~~~~~  ^
statement.c:261:32: error: use of undeclared identifier 'SIZEOF_BDIGITS'
      if (RBIGNUM_LEN(value) * SIZEOF_BDIGITS <= 8) {
                               ^
1 warning and 2 errors generated.
make: *** [statement.o] Error 1

make failed, exit code 2

Gem files will remain installed in /Users/Takahiro/.rbenv/versions/2.3.1/lib/ruby/gems/2.3.0/gems/sqlite3-1.3.8 for inspection.
Results logged to /Users/Takahiro/.rbenv/versions/2.3.1/lib/ruby/gems/2.3.0/extensions/x86_64-darwin-15/2.3.0-static/sqlite3-1.3.8/gem_make.out

Answer 1

いくつか同じ現象が報告されています。

https://github.com/sparklemotion/sqlite3-ruby/issues/181
https://github.com/sparklemotion/sqlite3-ruby/issues/157
https://gist.github.com/zzak/695d1e25ec13d62ca671#gistcomment-1364746

一つは自分でコンパイルしたときにライブラリ等のパスがおかしくなっていた？(自利解決したようで詳細は不明)という物です。rbenvでインストールしているのであればこの問題はたぶん発生しません。

もう一つの問題が重要で、sqlite3 1.3.8はRuby 2.2.0以上では動かないため、1.3.10以上に上げる必要があるという物です。パスから推測するに、Macでrbenvを使って2.3.1を入れているようですが、この2.3.1にsqlite3 1.3.8を入れることは(自分でパッチを当てるとかしない限り)不可能です。

取れる手段は二つです。

1. sqilet3を1.3.10以上にする(最新は1.3.12です)。

単純にbundle updateとすることで、最新になる場合があります。もし、これでうまくいかない場合は、"Gemfile"のsqlite3の所でバージョンが1.3.8固定に設定されている所を変更し、bundle updateを実施してください。もし、sqlite3が書いてなければ、gem sqlite3, '~> 1.3.10'と追加して、bundle updateしてください。もしかしたら、他のライブラリとの依存関係でバージョンコンフリクトが発生するかも知れません。その場合は、sqlite3を必要としているライブラリのバージョンもsqilet3 1.3.10以降を使うように上げてください。

1. Ruby 2.1.xを使う

rbenvで2.1.x系の最新を入れて、それを使用してください。(2.1.x系のサポートは来年4月頃には終了しますので、ご注意ください)

Comments

[tomato0]

Gemfileのsqlite3を1.3.8から1.3.10に変更後bundle installに変えたところ無事解決できました。
ありがとうございました。