WindowsとLinuxでMySQLを実行する際、何が違う？

皆さんの質問事項、いつも拝見させていただいています。
今回、私事ではあるのですが、ひとつ質問させていただきたいと思います。

WindowsとLinuxでPHPを利用してMySQLと接続する際、何が違うのかということです。
私は普段Linux環境で作業を行っています。
ある案件で、Linux環境で開発したものをWindows環境に設置して動作をさせることを行いました。
MTのデータベースからデータを取得し、PHPで加工して出力するといったものなのですが(ざっくりですみません。。)、いざWindowsに設置してみると、目に見えるほど表示速度に違いがありました。

ただしLinux環境では気になるほどの遅さではなく、Windowsに設置した状態ではとても遅いというものでした。
Mysqlのチューニングはこちらで考えうる限りは行い、かつ名前解決で躓くという問題(IPv4,IPv6の件)も、localhost→127.0.0.1に変更してあり、my.iniにはskip-name-resolveも念のため追記してあります。

下記、実際に行ってみた検証結果です。
一応PHPも確認してみましたが、早かったです。。。

【PHP速度検証】
<?php
$time_start = microtime(true);
for($i=0;$i<1000000;$i++) {
var_dump($i);
}
$time_end = microtime(true);
$time = $time_end - $time_start;

echo $time;

結果 ： windows 1.8961119651794
linux 1.9274280071259 

------------------------------------------------------------------------
【MySQL速度検証】
<?php
$time_start = microtime(true);
for ($i=0; $i < 300; $i++) {
    $link = mysql_connect('localhost', 'root', '');
    $db_selected = mysql_select_db('test2', $link);
    $result = mysql_query('SELECT * FROM tst');
    while ($row = mysql_fetch_assoc($result)) {
        print('<p>');
        print('id='.$row['id']);
        print(',name='.$row['name']);
        print('</p>');
    }
    mysql_close($link);
}
$time_end = microtime(true);
$time = $time_end - $time_start;

echo $time;

結果 ： windows 2.0411188602448
         linux 0.27686905860901

かなりな差がでた結果となってしまいました。。。
MySQL,PHP共にチューニング済みな状態です。また、connect部分はlocalhost→127.0.0.1に変更してwindowsでは実行しています。

もし、手掛かりになることをご存じの方がいらっしゃれば、ご教示頂けると幸いです。orz
よろしくお願い致します。