Mariadbでmysqldumpやselectすると、Lost connectionしてしまう

Question

CentOS 7.2.1511 / Mariadb 5.5.44

CentOSのローカルにインストールされているMariadbに対し、mysqldumpでダンプを取ろうとすると、Lost Connectionが発生して完了できません

[user@host ~]$ mysqldump -u user -p --add-drop-database --add-drop-table --complete-insert --create-options --flush-logs --single-transaction db_name > /tmp/db_name.dump.sql
Enter password:
mysqldump: Error 2013: Lost connection to MySQL server during query when dumping table `table_name` at row: 824

mysqldumpコマンドの実行から即時にこのエラーが発生する為、タイムアウト時間はあまり関係がないかなぁとは思いつつ、以下のようにread/writeのtimeoutを延長してみましたが、やはり状況は改善せず。

MariaDB [(none)]> show variables like '%timeout%';
+----------------------------+----------+
| Variable_name              | Value    |
+----------------------------+----------+
| connect_timeout            | 10       |
| deadlock_timeout_long      | 50000000 |
| deadlock_timeout_short     | 10000    |
| delayed_insert_timeout     | 300      |
| innodb_lock_wait_timeout   | 50       |
| innodb_rollback_on_timeout | OFF      |
| interactive_timeout        | 28800    |
| lock_wait_timeout          | 31536000 |
| net_read_timeout           | 30       |
| net_write_timeout          | 60       |
| slave_net_timeout          | 3600     |
| thread_pool_idle_timeout   | 60       |
| wait_timeout               | 28800    |
+----------------------------+----------+
13 rows in set (0.00 sec)

MariaDB [(none)]> set global net_read_timeout=3600;
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)

MariaDB [(none)]> set global net_write_timeout=3600;
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)

原因・解決法に心当たりあれば教えてください。

追記：
対象のDBに含まれるTableは全てInnoDBとなっています。

追記2：
対象のDBに対し、SELECT文を投げても同様にLost connectionするようでした。。

MariaDB [db_name]> select * from db_name.table;
ERROR 2013 (HY000): Lost connection to MySQL server during query

Answer 1

データが壊れている可能性があるようです。
mysqlcheck でも使って確認してみてください。
https://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/ja/mysqlcheck.html

Comments

[kunai]

回答ありがとうございます。
早速試してみましたが、「OK」と出力されてcheckは正常終了したようですが、やはりmysqldumpはLost connectionしてしまいます。
ちなみに対象のデータベースに含まれるテーブルはすべてInnoDBです。

[matsu]

他にもパケット数の制限でもひっかかるらしいので、max_allowed_packetの値も確認して、上げてみてください。

[kunai]

追加の指摘ありがとうございます。
max_allowed_packetの値は１MBでしたので、最大値らしい16MBへ引き上げて実施しても同じエラーが発生します。
10GBまで引き上げても同じエラーとなっています。
mysqldump自体はサーバ内で行っており、サーバに投げているデータは上記のコマンドのみの為、packetの値はあまり関係ない気もしています。
(WEBの画面からデータを投入したりというわけではないので。。)