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R

R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

Q&A

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PythonでRのlibrary(multcomp)が実行できません。

m.yagihashi

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R

R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

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Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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投稿2021/12/14 08:05

PythonでRのlibrary(multcomp)が実行できません。

Pythonのpyperを使用してRを実行するプログラムを作成しています。
2元配置分散分析と共分散分析はうまくいきました。
現在Dunnettの検定に取り組んでおります。
R単体ではうまく結果を得られるのですが、PythonからRを実行すると何も結果が帰ってきません。
RのDunnettの検定では「library(multcomp)」としてmultcompパッケージを呼び出す必要があるのですが、
どうもこの箇所でエラーとなっているようです。
PythonでRのlibrary(multcomp)を実行できる方法を教えてください。
よろしくお願いします。

発生している問題・エラーメッセージ

# dunnettソースファイル dunnett <- function(dataset){ gun = factor(dataset$gun) atai = dataset$atai library(multcomp) #←ここでエラーとなっているようです。 summary(glht(aov(atai~gun),linfct=mcp(gun="Dunnett"))) }

該当のソースコード

# Pythonソース # Python実行パス python_path = 'C:/python' # excelファイルからデータセットの読み込み df = pd.read_excel(python_path + '/dunnett_data.xlsx') # Rを利用するためのインスタンスの生成 r = pyper.R(RCMD="C://Program Files//R//R-4.1.0//bin//x64//R", use_numpy='True', use_pandas='True') # DataFrameをRにおけるデータに格納 r.assign('data', df) # dunnettソースファイルの読み込み r("source('" + python_path + "/dunnett.txt', encoding='utf-8')") # R実行 result = r('dunnett(data)') #←結果がなにも帰ってきません。

試したこと

Pythonから読み込むソースファイルの該当箇所はコメントアウトして、以下のようにPythonに直接記述してもダメでした。

# DataFrameをRにおけるデータに格納 r.assign('data', df) r('library(multcomp)') #←ここにこのように直接記述しましたがダメでした。 # dunnettソースファイルの読み込み r("source('" + python_path + "/dunnett.txt', encoding='utf-8')") # R実行 result = r('dunnett(data)')

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

Python3.9(64-bit)
R x64 4.1.0

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